Exploiting the neoantigen landscape for immunotherapy of pancreatic ductal adenocarcinoma.
Exploiting the neoantigen landscape for immunotherapy of pancreatic ductal adenocarcinoma.
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DOI：
10.1038/srep35848
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发表时间：
2016-10-20
影响因子：
4.6
通讯作者：
Roszik J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bailey P;Chang DK;Forget MA;Lucas FA;Alvarez HA;Haymaker C;Chattopadhyay C;Kim SH;Ekmekcioglu S;Grimm EA;Biankin AV;Hwu P;Maitra A;Roszik J
胰腺导管腺癌（PDAC）的免疫治疗方法取得了有限的成功。据推测，低突变负荷可能导致肿瘤微环境（TME）内T细胞的缺乏。然而，也可能的是，虽然存在新抗原，但由于免疫抑制性TME而不能产生有效的免疫应答。为了辨别PDAC中是否存在可靶向的新抗原，我们使用从公共数据库中提取的221例PDAC病例的基因组图谱进行了全面的研究。我们的研究结果表明：（a）几乎所有的PDAC样品都具有潜在的可靶向的新抗原;（B）存在T细胞，但通常显示出降低的活化特征;和（c）有效抗原呈递的标志物与表征细胞毒性T细胞的标志物的降低的特征相关。这些发现表明，尽管存在肿瘤特异性新表位，但T细胞活化在PDAC中被主动抑制。此外，我们确定iNOS作为免疫抑制的潜在介质，可能是可操作的使用药理学途径。
Immunotherapy approaches for pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) have met with limited success. It has been postulated that a low mutation load may lead to a paucity of T cells within the tumor microenvironment (TME). However, it is also possible that while neoantigens are present, an effective immune response cannot be generated due to an immune suppressive TME. To discern whether targetable neoantigens exist in PDAC, we performed a comprehensive study using genomic profiles of 221 PDAC cases extracted from public databases. Our findings reveal that: (a) nearly all PDAC samples harbor potentially targetable neoantigens; (b) T cells are present but generally show a reduced activation signature; and (c) markers of efficient antigen presentation are associated with a reduced signature of markers characterizing cytotoxic T cells. These findings suggest that despite the presence of tumor specific neoepitopes, T cell activation is actively suppressed in PDAC. Further, we identify iNOS as a potential mediator of immune suppression that might be actionable using pharmacological avenues.
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Janakiram NB;Rao CV
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通讯作者：
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通讯作者：
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11.1
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通讯作者：
Fearon, Douglas T.