鱖鱼rxr基因家族的全基因组鉴定、组织表达及镉暴露对其节律表达的影响
鱖鱼rxr基因家族的全基因组鉴定、组织表达及镉暴露对其节律表达的影响
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DOI：
10.13417/j.gab.041.001825
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
褚武英
中科院分区：
文献类型：
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作者：
张宇;潘亚雄;李慧菊;陶晋升;周俊;潘佳琳;王爱民;张建社;褚武英
视黄醇X受体(retinoid x recepto,RXR)是核受体超家族的重要成员。本研究旨在分析鳜鱼(Siniperca chuatsi) rxr基因家族的分子特征,检测其不同亚型在各组织中的表达模式,进一步为鱼类中不同rxr基因亚型的差异性研究提供理论依据。本研究对鳜鱼rxr基因家族序列特征、同源性及进化关系进行了分析,并利用实时荧光定量PCR技术检测4个亚型在鳜鱼各组织中的表达模式与肠道中的昼夜表达节律。结果表明,鳜鱼4个rxr基因亚型在cDNA序列长度和开放阅读框上存在差异,但其编码氨基酸序列都包含两个典型的核受体结构域。鳜鱼相比哺乳类多1个rxrβb基因亚型,系统进化树分析表明,rxrβb是由硬骨鱼特异性全基因组复制事件产生的。4种鳜鱼rxr基因亚型在所检测的鳜鱼组织中均有表达,且具有特异的组织表达模式,其中rxrαa基因亚型在鳜鱼各组织中均为低水平表达,在鳜鱼肝脏组织中相对表达最高。鳜鱼rxrgb主要在肝脏和肌肉组织中高表达,在肠道等其他组织中低水平表达。鳜鱼rxrβa与rxrβb具有相似的组织表达模式,均在脑组织中表达最高。在对鳜鱼肠道组织中4种rxr基因亚型进行24 h昼夜节律表达分析的研究中,发现rxrβa和rxrgb在肠道中表达呈现显著的昼夜节律性。水体镉暴露(Cd 20 µg/L,7 days)下,鳜鱼肠道rxrβa的振幅下降,昼夜节律消失,rxrgb则呈现昼夜持续性高表达,昼夜节律性消失。此外,水体镉暴露导致鳜鱼肠道rrxrαa在夜间授时因子时间(zeitgeber time,ZT) 12~24 h的表达量相比对照组显著上调。本研究表明rxr基因是重金属镉暴露的靶基因,水体镉暴露能导致鳜鱼肠道rxr基因昼夜节律紊乱。