メタボロームデータ解析および解釈に資する可視化手法

メタボロームデータ解析および解釈に資する可視化手法
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代谢组数据分析和解释的可视化方法

DOI:
10.11546/cicsj.37.72
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发表时间:
2019
期刊:
CICSJ Bulletin
影响因子:
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通讯作者:
福島 敦史
福島 敦史
中科院分区:
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文献类型:
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作者:
神谷 健;草野 都;福島 敦史

文献摘要

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代謝物とは, 動物の場合生体内のアミノ酸や有機酸である一次代謝物およびその誘導体を含む低分子化合物であり, 微生物や植物代謝物では, それぞれが特有に生産する二次代謝物を含む. それら総体をメタボロームと呼び, 代謝物を網羅的に研究する学問はメタボロミクスと呼ばれる. メタボロミクスは代謝パスウェイを基にしてその変動を捉え, 組織・種ごとの違いを見出す. 本稿では, 探索的データ解析や種々のプロット手法をはじめ, 代謝物データ解析および解釈に資する可視化手法を紹介する. また, 再現可能な統計解析環境 R のサンプルコードを付属する.