Riboneogenesis in yeast.
Riboneogenesis in yeast.
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DOI：
10.1016/j.cell.2011.05.022
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发表时间：
2011-06-10
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Caudy AA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Clasquin MF;Melamud E;Singer A;Gooding JR;Xu X;Dong A;Cui H;Campagna SR;Savchenko A;Yakunin AF;Rabinowitz JD;Caudy AA
葡萄糖异生将三个碳单位转化为葡萄糖。在这里，我们确定了一个类似的途径，在酿酒酵母转化为核糖，核酸和核苷酸的组成部分的三个碳单位。该核糖新生途径涉及酶景天庚酮糖-1，7-二磷酸酶（SHB 1,7），其活性基于相应敲除菌株中景天庚酮糖-1，7-二磷酸的积累来鉴定。我们确定了Shb 1, 7与景天庚酮糖-1，7-二磷酸复合物的晶体结构，发现糖在活性位点以封闭的呋喃形式结合。与果糖-1，6-二磷酸类似，景天庚酮糖-1，7-二磷酸由醛缩酶产生，在这种情况下由赤藓糖4-磷酸和二羟丙酮磷酸产生。SHB 17水解景天庚酮糖-1，7-二磷酸为非氧化戊糖磷酸途径提供了能量上有利的输入，以驱动核糖生产。在核糖需求相对于NADPH需求高的条件下，通过SHB 17的通量增强，包括在代谢同步的酵母细胞中的核糖体生物合成期间。因此，核糖异生提供了一种与NADPH形成解偶联的核糖产生的代谢驱动途径。
Gluconeogenesis converts three carbon units into glucose. Here we identify an analogous pathway in Saccharomyces cerevisiae for converting three carbon units into ribose, a component of nucleic acids and nucleotides. This riboneogenic pathway involves the enzyme sedoheptulose-1,7-bisphosphatase (SHB17), whose activity was identified based on accumulation of sedoheptulose-1,7-bisphosphate in the corresponding knockout strain. We determined the crystal structure of Shb17 in complex with sedoheptulose-1,7-bisphosphate, and found that the sugar is bound in the closed furan form in the active site. Like fructose-1,6-bisphosphate, sedoheptulose-1,7-bisphosphate is produced by aldolase, in this case from erythrose 4-phosphate and dihydroxyacetone phosphate. Hydrolysis of sedoheptulose-1,7-bisphosphate by SHB17 provides an energetically favorable input to the non-oxidative pentose phosphate pathway to drive ribose production. Flux through SHB17 is enhanced under conditions when ribose demand is high relative to demand for NADPH, including during ribosome biogenesis in metabolically synchronized yeast cells. Thus, riboneogenesis provides a thermodynamically-driven route of ribose production uncoupled from formation of NADPH.
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影响因子：
4.1
作者：
BERTHON, HA;BUBB, WA;KUCHEL, PW
通讯作者：
KUCHEL, PW
影响因子：
14.8
作者：
Bennett, Bryson D.;Yuan, Jie;Rabinowitz, Joshua D.
通讯作者：
Rabinowitz, Joshua D.
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
5.4
作者：
Kleijn, RJ;van Winden, WA;Heijnen, JJ
通讯作者：
Heijnen, JJ
影响因子：
4.8
作者：
Brown, Greg;Singer, Alexander;Yakunin, Alexander F.
通讯作者：
Yakunin, Alexander F.