2010-2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
2010-2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况
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DOI：
10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2016.01.014
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发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
梁浩
中科院分区：
文献类型：
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作者：
王洪;梁冰玉;周波;蒋俊俊;黄颉刚;陈荣风;赵芳凝;王敏连;刘洁;李汶蔚;叶力;梁浩
目的：分析广西壮族自治区(广西)HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况。方法于2010年1月1日至2012年12月31日，采用方便抽样的方法，在广西11个城市开展调查，通过问卷调查收集调查对象的流行病学资料。纳入标准为：Western blot确证HIV-1阳性、病毒载量>1000拷贝/ml、>18岁及无特殊重大疾病。共招募到调查对象152例。采集每例调查对象5 ml外周血并提取病毒基因组RNA，采用巢式RT-PCR扩增病毒pol区全长基因并测序；对所得序列修正后用Genotyping进行初步分型；采用MEGA 5.03软件构建系统进化树对pol序列分型进行验证；采用RIP及jpHMM at GOBICS程序分析未知重组毒株的重组断点。结果152例HIV-1感染者共成功扩增出137例pol区全长基因，共获得127例HIV-1亚型判定，其中CRF01_AE占55.9%（71例），CRF08_BC占29.9%（38例）， CRF07_BC占10.2%（13例），B(B')占2.4%（3例），未知重组型占1.6%（2例）。广西11个城市以CRF01_AE亚型流行为主；异性性传播和注射毒品传播感染HIV-1者间CRF01_AE亚型分布差异有统计学意义（χ2=15.07，P60岁HIV-1感染者中，CRF01_AE亚型所占比例分别为43.6%（17/39）、57.6%（38/66）、77.3%（17/22）， CRF_08BC亚型所占比例分别为43.6%（17/39）、28.8%（19/66）、9.1%（2/22），差异有统计学意义（χ2=8.48，P=0.014）。2株未知重组型毒株的模式分别为CRF01_AE/B(B')和CRF01_AE/C/B(B')重组型。结论2010—2012年广西HIV-1流行株pol基因主要流行亚型为CRF01_AE，以异性性传播为主；出现的未知重组型毒株是由CRF01_AE与CRF_BC重组产生的。