Proteomic cellular signatures of kinase inhibitor-induced cardiotoxicity.
Proteomic cellular signatures of kinase inhibitor-induced cardiotoxicity.
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激酶抑制剂诱导的心脏毒性的蛋白质组学细胞特征。
DOI：
10.1038/s41597-021-01114-3
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发表时间：
2022-01-20
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Azeloglu EU
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Xiong Y;Liu T;Chen T;Hansen J;Hu B;Chen Y;Jayaraman G;Schürer S;Vidovic D;Goldfarb J;Sobie EA;Birtwistle MR;Iyengar R;Li H;Azeloglu EU
位于西奈山的伊坎医学院的药物毒性信号生成中心(DToxS)是NIH基于网络的细胞信号集成图书馆(LINCS)计划的中心之一。它的主要目标是产生蛋白质组和转录组特征，可以预测美国食品和药物管理局批准的激酶抑制剂的心脏毒性副作用。为此，我们进行了高通量的鸟枪蛋白质组学实验(308个细胞系/药物组合+对照裂解物)。利用计算网络分析，这些蛋白质组数据可以与串联产生的转录签名相结合，以识别心脏毒性的细胞签名，这些签名可以预测激酶抑制剂诱导的毒性，并使可能的缓解成为可能。原始和加工的蛋白质组学数据都通过了几个质量控制步骤，并在Pride数据库上公开可用。这一广泛的蛋白激酶抑制剂刺激的人类心肌细胞蛋白质组数据和签名集对于预测药物毒性是有价值的。描述上报数据的机器可访问的元数据文件：10.6084/m9.figShar.16990033
Drug Toxicity Signature Generation Center (DToxS) at the Icahn School of Medicine at Mount Sinai is one of the centers for the NIH Library of Integrated Network-Based Cellular Signatures (LINCS) program. Its key aim is to generate proteomic and transcriptomic signatures that can predict cardiotoxic adverse effects of kinase inhibitors approved by the Food and Drug Administration. Towards this goal, high throughput shotgun proteomics experiments (308 cell line/drug combinations +64 control lysates) have been conducted. Using computational network analyses, these proteomic data can be integrated with transcriptomic signatures, generated in tandem, to identify cellular signatures of cardiotoxicity that may predict kinase inhibitor-induced toxicity and enable possible mitigation. Both raw and processed proteomics data have passed several quality control steps and been made publicly available on the PRIDE database. This broad protein kinase inhibitor-stimulated human cardiomyocyte proteomic data and signature set is valuable for prediction of drug toxicities. Machine-accessible metadata file describing the reported data: 10.6084/m9.figshare.16990033
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