The inositol pyrophosphate metabolism of Dictyostelium discoideum does not regulate inorganic polyphosphate (polyP) synthesis.
The inositol pyrophosphate metabolism of Dictyostelium discoideum does not regulate inorganic polyphosphate (polyP) synthesis.
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DOI：
10.1016/j.jbior.2021.100835
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发表时间：
2022-01
影响因子：
--
通讯作者：
Saiardi A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Desfougères Y;Portela-Torres P;Qiu D;Livermore TM;Harmel RK;Borghi F;Jessen HJ;Fiedler D;Saiardi A
对磷酸肌醇代谢的初步研究是由社会阿米巴盘基网柄菌进行的。变形虫中存在大量的肌醇六磷酸（IP6，也称为植酸），从而发现了极性更强的肌醇焦磷酸 IP7 和 IP8，它们分别具有一个或两个高能磷酸酐键。考虑到当代人们对肌醇焦磷酸的兴趣日益浓厚，令人惊讶的是，近年来盘状 D. discoideum 对我们对其代谢和功能的理解贡献甚微。这项工作通过使用 PAGE、13C-NMR 和 CE-MS 分析来分析 ip6k、ppip5k 和 ip6k-ppip5K 阿米巴无效菌株，填补了这一空白。我们的研究揭示了肌醇焦磷酸代谢比以前想象的更复杂。变形虫 Ip6k 合成 4/6-IP7，与哺乳动物同源物合成的 5-IP7 异构体相反。变形虫 Ppip5k 合成与哺乳动物酶相同的 1/3-IP7。在 D. discoideum 中，ip6k 菌株拥有残留量的 IP7。残留的 IP7 也存在于 ip6k-ppip5K 菌株中，而 ppip5k 单突变体显示 IP7 和 IP8 水平均下降。这种表型与酵母 vip1Δ 菌株中可观察到的 IP7 的增加形成对比。 ppip5k 中 IP8 的存在和 ip6k-ppip5K 中 IP7 的存在表明存在额外的肌醇焦磷酸合成酶。此外，我们还研究了在酵母中观察到的肌醇焦磷酸合成与无机多磷酸盐 (polyP) 代谢之间是否存在代谢关系。这些研究表明，与酵母相反，Ip6k 和 Ppip5k 不控制变形虫中的 PolyP 细胞水平。
Initial studies on the inositol phosphates metabolism were enabled by the social amoeba Dictyostelium discoideum. The abundant amount of inositol hexakisphosphate (IP6 also known as Phytic acid) present in the amoeba allowed the discovery of the more polar inositol pyrophosphates, IP7 and IP8, possessing one or two high energy phosphoanhydride bonds, respectively. Considering the contemporary growing interest in inositol pyrophosphates, it is surprising that in recent years D. discoideum, has contributed little to our understanding of their metabolism and function. This work fulfils this lacuna, by analysing the ip6k, ppip5k and ip6k-ppip5K amoeba null strains using PAGE, 13C-NMR and CE-MS analysis. Our study reveals an inositol pyrophosphate metabolism more complex than previously thought. The amoeba Ip6k synthesizes the 4/6-IP7 in contrast to the 5-IP7 isomer synthesized by the mammalian homologue. The amoeba Ppip5k synthesizes the same 1/3-IP7 as the mammalian enzyme. In D. discoideum, the ip6k strain possesses residual amounts of IP7. The residual IP7 is also present in the ip6k-ppip5K strain, while the ppip5k single mutant shows a decrease in both IP7 and IP8 levels. This phenotype is in contrast to the increase in IP7 observable in the yeast vip1Δ strain. The presence of IP8 in ppip5k and the presence of IP7 in ip6k-ppip5K indicate the existence of an additional inositol pyrophosphate synthesizing enzyme. Additionally, we investigated the existence of a metabolic relationship between inositol pyrophosphate synthesis and inorganic polyphosphate (polyP) metabolism as observed in yeast. These studies reveal that contrary to the yeast, Ip6k and Ppip5k do not control polyP cellular level in amoeba.
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影响因子：
14.9
作者：
Faix, J;Kreppel, L;Kimmel, AR
通讯作者：
Kimmel, AR
DOI：
10.1016/j.bbadis.2016.06.014
发表时间：
2016-09-01
影响因子：
6.2
作者：
Crocco, Paolina;Saiardi, Adolfo;Rose, Giuseppina
通讯作者：
Rose, Giuseppina
影响因子：
4.8
作者：
Choi, Jae H.;Williams, Jason;Shears, Stephen B.
通讯作者：
Shears, Stephen B.
影响因子：
--
作者：
Draskovic, Petra;Saiardi, Adolfo;Podobnik, Marjetka
通讯作者：
Podobnik, Marjetka
影响因子：
3.7
作者：
Choi J;Rajagopal A;Xu YF;Rabinowitz JD;O'Shea EK
通讯作者：
O'Shea EK