Structural insights into the regulatory particle of the proteasome from Methanocaldococcus jannaschii.
Structural insights into the regulatory particle of the proteasome from Methanocaldococcus jannaschii.
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DOI：
10.1016/j.molcel.2009.04.021
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发表时间：
2009-05-14
期刊：
影响因子：
16
通讯作者：
Shi, Yigong
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang, Fan;Hu, Min;Tian, Geng;Zhang, Ping;Finley, Daniel;Jeffrey, Philip D.;Shi, Yigong
真核蛋白酶体由降解未折叠蛋白的核心颗粒（CP）和负责多泛素化底物蛋白识别、atp依赖性展开和易位的调节颗粒（RP）组成。在jannaschii甲烷醛球菌中，RP是蛋白酶体激活核苷酸酶（PAN）的同六聚体复合体。在这里，我们报告了古细菌蛋白酶体的基本元素的晶体结构：CP， PAN的atp酶结构域，以及可能首先遇到底物的远端亚复合物。远端亚复合体包含一个线圈段和一个OB-fold结构域，这两个结构域似乎在真核蛋白酶体中是保守的。PAN的OB结构域形成一个具有13-Å孔的六聚环，这可能构成了底物易位通道的最外层收缩。这些研究揭示了完整蛋白酶体的结构代码和结构，确定了潜在的底物结合位点，并揭示了古细菌和真核生物RP中意想不到的不对称性。
Eukaryotic proteasome consists of a core particle (CP), which degrades unfolded protein, and a regulatory particle (RP), which is responsible for recognition, ATP-dependent unfolding and translocation of polyubiquitinated substrate protein. In the archaea Methanocaldococcus jannaschii, the RP is a homohexameric complex of proteasome-activating nucleotidase (PAN). Here we report the crystal structures of essential elements of the archaeal proteasome: the CP, the ATPase domain of PAN, and a distal subcomplex that is likely the first to encounter substrate. The distal subcomplex contains a coiled-coil segment and an OB-fold domain, both of which appear to be conserved in the eukaryotic proteasome. The OB domains of PAN form a hexameric ring with a 13-Å pore, which likely constitutes the outermost constriction of the substrate translocation channel. These studies reveal structural codes and architecture of the complete proteasome, identify potential substrate-binding sites, and uncover unexpected asymmetry in the RP of archaea and eukaryotes.
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DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
3.6
作者：
Hu, GQ;Lin, G;Li, HL
通讯作者：
Li, HL
DOI：
10.1038/80992
发表时间：
2000-11-01
期刊：
NATURE STRUCTURAL BIOLOGY
影响因子：
--
作者：
Groll, M;Bajorek, M;Finley, D
通讯作者：
Finley, D
影响因子：
5.6
作者：
Groll, M;Brandstetter, H;Huber, R
通讯作者：
Huber, R
影响因子：
64.8
作者：
Groll, M;Ditzel, L;Huber, R
通讯作者：
Huber, R