Imaging Chromatin Accessibility by Assay of Transposase-Accessible Chromatin with Visualization
Imaging Chromatin Accessibility by Assay of Transposase-Accessible Chromatin with Visualization
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通过可视化检测转座酶可及染色质来成像染色质可及性
DOI：
10.1007/978-1-0716-2724-2_7
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发表时间：
2022
影响因子：
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通讯作者：
Miyanari Yusuke
中科院分区：
文献类型：
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作者：
森下和浩;渡邊謙吾;名黒功;一條秀憲;Miyanari Yusuke
染色质可及性是调控基因组转录和DNA修复等功能的基本结构之一。最近的技术优势，分析染色质可及性开始探索局部染色质结构的动力学。在这里，我描述的协议与可视化转座酶-可接近的染色质（ATAC-见），这使我们能够分析亚核定位的可接近的染色质和量化可接近的染色质在单细胞水平。
Chromatin accessibility is one of the fundamental structures regulating genome functions including transcription and DNA repair. Recent technological advantages to analyze chromatin accessibility begun to explore the dynamics of local chromatin structures. Here I describe protocols for Assay of Transposase-Accessible Chromatin with Visualization (ATAC-see), which allows us to analyze subnuclear localization of accessible chromatin and quantify accessible chromatin at single-cell level.