Terminal Deoxynucleotidyl Transferase Mediated Production of Labeled Probes for Single-molecule FISH or RNA Capture
Terminal Deoxynucleotidyl Transferase Mediated Production of Labeled Probes for Single-molecule FISH or RNA Capture
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DOI：
10.21769/bioprotoc.2750
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发表时间：
2018-03-05
期刊：
影响因子：
0.8
通讯作者：
Ephrussi, Anne
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Gaspar, Imre;Wippich, Frank;Ephrussi, Anne
短的、单标记的ssDNA寡核苷酸的阵列使得能够进行具有单分子灵敏度和有效的转录物特异性RNA捕获的原位杂交。在这里，我们描述了一个简单的，酶的协议，可以使用基本的实验室设备进行转换成smFISH和RAP探针集的PCR寡核苷酸阵列在定量，成本效益和灵活的方式。
Arrays of short, singly-labeled ssDNA oligonucleotides enable in situ hybridization with single molecule sensitivity and efficient transcript specific RNA capture. Here, we describe a simple, enzymatic protocol that can be carried out using basic laboratory equipment to convert arrays of PCR oligos into smFISH and RAP probesets in a quantitative, cost-efficient and flexible way.