Quantitative analysis of super-resolved structures using ASAP
Quantitative analysis of super-resolved structures using ASAP
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DOI：
10.1038/s41592-019-0472-1
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发表时间：
2019-08-01
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Garcia-Saez, Ana J.
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Danial, John S. H.;Garcia-Saez, Ana J.
超分辨率显微镜允许高通量和细节的细胞结构成像。然而，利用现有工具对生成的图像进行有效和定量分析是具有挑战性的。在这里，我们开发ASAP（自动结构分析程序），以实现快速和自动检测，分类和定量的超分辨结构。我们验证ASAP地面实况数据，并通过分析核孔蛋白，TORC 1复合物，内吞囊泡和Bax孔的图像证明其广泛的适用性。
Super-resolution microscopy allows imaging of cellular structures with high throughput and detail. However, the efficient and quantitative analysis of images generated is challenging with existing tools. Here, we develop ASAP (automated structures analysis program) to enable rapid and automated detection, classification and quantification of super-resolved structures. We validate ASAP on ground truth data and demonstrate its broad applicability by analyzing images of nucleoporins, TORC1 complexes, endocytic vesicles and Bax pores.