DNA methylation affects nuclear organization, histone modifications, and linker histone binding but not chromatin compaction.
DNA methylation affects nuclear organization, histone modifications, and linker histone binding but not chromatin compaction.
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DOI：
10.1083/jcb.200607133
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发表时间：
2007-05-07
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Bickmore WA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gilbert N;Thomson I;Boyle S;Allan J;Ramsahoye B;Bickmore WA
DNA甲基化与染色质凝聚和核组织有关，特别是在构成异染色质的部位。这是如何调解的，目前尚不清楚。在这项研究中，使用完全缺乏DNA甲基化的突变小鼠胚胎干细胞，我们发现DNA甲基化影响核组织和核小体结构，但不影响染色质紧致。在没有DNA甲基化的情况下，着丝粒周围异染色质的核聚集性增加，初级染色质结构发生广泛变化。组蛋白H3甲基化和乙酰化的整体水平发生改变，连接器组蛋白的流动性降低。然而，通过核酸酶消化和蔗糖梯度沉淀法检测，大量染色质和异染色质的紧致不会因DNA甲基化的丧失而改变。这项研究展示了一个主要表观遗传标记的完全丧失如何对染色质结构和核组织的意外水平产生影响，并为DNA甲基化和连接物组蛋白在染色质结构调节中的新联系提供了证据。
DNA methylation has been implicated in chromatin condensation and nuclear organization, especially at sites of constitutive heterochromatin. How this is mediated has not been clear. In this study, using mutant mouse embryonic stem cells completely lacking in DNA methylation, we show that DNA methylation affects nuclear organization and nucleosome structure but not chromatin compaction. In the absence of DNA methylation, there is increased nuclear clustering of pericentric heterochromatin and extensive changes in primary chromatin structure. Global levels of histone H3 methylation and acetylation are altered, and there is a decrease in the mobility of linker histones. However, the compaction of both bulk chromatin and heterochromatin, as assayed by nuclease digestion and sucrose gradient sedimentation, is unaltered by the loss of DNA methylation. This study shows how the complete loss of a major epigenetic mark can have an impact on unexpected levels of chromatin structure and nuclear organization and provides evidence for a novel link between DNA methylation and linker histones in the regulation of chromatin structure.
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影响因子：
1.6
作者：
Gisselsson, D;Shao, CB;Ehrlich, M
通讯作者：
Ehrlich, M
DOI：
10.1073/pnas.211322798
发表时间：
2001-10-09
影响因子：
11.1
作者：
Gilbert, N;Allan, J
通讯作者：
Allan, J
影响因子：
9.2
作者：
Lehnertz, B;Ueda, Y;Peters, AHFM
通讯作者：
Peters, AHFM
影响因子：
11.4
作者：
Gilbert, N;Boyle, S;Bickmore, WA
通讯作者：
Bickmore, WA
影响因子：
4.8
作者：
Carruthers, LM;Hansen, JC
通讯作者：
Hansen, JC