樟属植物ITS序列多态性分析

樟属植物ITS序列多态性分析
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DOI:
10.11983/cbb15141
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发表时间:
2015
期刊:
植物学报
影响因子:
--
通讯作者:
李捷
李捷
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
黄建峰;李朗;李捷

文献摘要

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对樟科樟属(Cinnamomum Schaeffer) 17个代表样本的核糖体DNA内转录间隔区(nrDNA ITS)进行克隆测序。对获 得的87条不同ITS序列的长度变异、GC含量、5.8S区二级结构的稳定性、遗传距离、进化模式以及系统发育关系进行了相 关分析。研究结果显示, ITS序列在樟属植物内存在明显的多态性, 87条序列中的22条序列被鉴定为假基因序列, 其余65条 序列为功能基因序列; 假基因序列采用中性进化模式, 变异明显大于功能序列。ITS序列在樟属植物中出现一致性进化不完 全和假基因现象也可能发生在樟科其它类群中, 这可能是导致樟科植物ITS序列直接测序方式成功率低的重要原因。