Lattice Paths for Persistent Diagrams.
Lattice Paths for Persistent Diagrams.
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DOI：
10.1007/978-3-030-87444-5_8
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发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ombao H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chung MK;Ombao H
近年来，持久同源性得到了显着的发展。然而，一个突出的挑战是在持久图上构建连贯的统计推断过程。在本文中，我们首先提出了持久图的新格路径表示。然后，我们通过组合枚举为格路径开发一种新的精确统计推断程序。格路径法应用于COVID-19病毒蛋白质结构的拓扑表征。我们证明了刺突蛋白构象变化期间存在拓扑变化。
Persistent homology has undergone significant development in recent years. However, one outstanding challenge is to build a coherent statistical inference procedure on persistent diagrams. In this paper, we first present a new lattice path representation for persistent diagrams. We then develop a new exact statistical inference procedure for lattice paths via combinatorial enumerations. The lattice path method is applied to the topological characterization of the protein structures of the COVID-19 virus. We demonstrate that there are topological changes during the conformational change of spike proteins.
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DOI：
10.1073/pnas.1313480110
发表时间：
2013-11-12
影响因子：
11.1
作者：
Chan, Joseph Minhow;Carlsson, Gunnar;Rabadan, Raul
通讯作者：
Rabadan, Raul
影响因子：
1.1
作者：
Billera, LJ;Holmes, SP;Vogtmann, K
通讯作者：
Vogtmann, K
影响因子：
13.6
作者：
Meng Z;Xia K
通讯作者：
Xia K
影响因子：
56.9
作者：
Cai, Yongfei;Zhang, Jun;Chen, Bing
通讯作者：
Chen, Bing
影响因子：
64.5
作者：
Walls, Alexandra C.;Park, Young-Jun;Veesler, David
通讯作者：
Veesler, David