Visualization of proteomics data using R and bioconductor.
Visualization of proteomics data using R and bioconductor.
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DOI：
10.1002/pmic.201400392
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发表时间：
2015-04
期刊：
影响因子：
3.4
通讯作者：
Gibb S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gatto L;Breckels LM;Naake T;Gibb S
数据可视化在高通量生物学中起着关键作用。它是数据探索的重要工具，可以揭示数据结构和感兴趣的模式。可视化作为向广大受众传达数据的一种形式也至关重要。在这里，我们简要介绍了R软件在蛋白质组学数据可视化中的应用。我们提出了一个R的绘图系统，以及如何使用它们来可视化和理解原始和处理MS为基础的蛋白质组学数据的摘要。
Data visualization plays a key role in high-throughput biology. It is an essential tool for data exploration allowing to shed light on data structure and patterns of interest. Visualization is also of paramount importance as a form of communicating data to a broad audience. Here, we provided a short overview of the application of the R software to the visualization of proteomics data. We present a summary of R's plotting systems and how they are used to visualize and understand raw and processed MS-based proteomics data.