牛血液中一株新型环状病毒的分离与全基因组序列分析
牛血液中一株新型环状病毒的分离与全基因组序列分析
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DOI：
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发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
李华春
中科院分区：
文献类型：
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作者：
杨恒;李占鸿;张怡轩;高林;谢佳芮;廖德芳;吴健敏;李华春
我们从广西省哨兵动物牛上采集的血液样本中分离到一株病毒，暂将其命名为广西环状病毒（毒株号：V172/GX/2015）。病毒接种C6/36细胞后可产生明显的细胞病变，表现为细胞聚集、皱缩与脱落。高分辨率琼脂糖凝胶电泳显示，病毒基因组由10节段的双链RNA组成，在凝胶上呈现“3-4-3”的带型特征。通过全长cDNA扩增与高通量测序方法获取V172/GX/2015毒株的全基因组序列。病毒基因组大小为19889 bp，基因节段的大小在3996bp（Seg-1）至829 bp（Seg-10）之间，可编码VP1至VP7等7种结构蛋白以及NS1至NS3等3种非结构蛋白。对环状病毒属保守的VP1、VP3（T2）与VP7（T13）蛋白氨基酸序列分析与系统发育树分析显示，V172/GX/2015与蚊传播环状病毒Yunnan orbivirus、Peruvian horse sickness virus以及Mobuck virus具有较近的亲缘关系，氨基酸序列相似度在31.4%至69.9%之间；V172/GX/2015在系统发育树上形成了一个独立于其它环状病毒的进化分支。本研究首次报道了一种新型环状病毒在牛上的分离与全基因组序列，研究结果将进一步丰富我们对环状病毒属病毒的认知，为开展新型环状病毒的流行病学调查与致病性研究提供基础。