Real-time observation of transcription initiation and elongation on an endogenous yeast gene.
Real-time observation of transcription initiation and elongation on an endogenous yeast gene.
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DOI：
10.1126/science.1202142
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发表时间：
2011-04-22
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Singer RH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Larson DR;Zenklusen D;Wu B;Chao JA;Singer RH
细胞信使RNA水平是通过控制转录的因子的组合复杂性来实现的，然而参与这些途径的少量分子随机波动。它还没有实验上可能观察到的活动，单一的聚合酶对内源性基因，以阐明这些事件如何发生在体内。在这里，我们描述了一种荧光标记的RNA的波动分析方法，以测量动态的新生RNA，包括启动，延长和终止，在一个活跃的酵母位点。我们发现在起始事件之间没有转录记忆，并且延伸速度在整个细胞周期中可以变化三倍。通过测量上游转录因子的丰度和核内迁移率，我们观察到基因发射率直接由反式激活因子搜索时间决定。
Cellular messenger RNA levels are achieved by the combinatorial complexity of factors controlling transcription, yet the small number of molecules involved in these pathways fluctuates stochastically. It has not yet been experimentally possible to observe the activity of single polymerases on an endogenous gene to elucidate how these events occur in vivo. Here, we describe a method of fluctuation analysis of fluorescently labeled RNA to measure dynamics of nascent RNA—including initiation, elongation, and termination—at an active yeast locus. We find no transcriptional memory between initiation events, and elongation speed can vary by threefold throughout the cell cycle. By measuring the abundance and intranuclear mobility of an upstream transcription factor, we observe that the gene firing rate is directly determined by trans-activating factor search times.
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影响因子：
16.8
作者：
通讯作者：
--
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通讯作者：
Xie, X. Sunney
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作者：
Darzacq X;Yao J;Larson DR;Causse SZ;Bosanac L;de Turris V;Ruda VM;Lionnet T;Zenklusen D;Guglielmi B;Tjian R;Singer RH
通讯作者：
Singer RH
DOI：
10.1073/pnas.0710336105
发表时间：
2007-12-18
影响因子：
11.1
作者：
Slaughter, Brian D.;Schwartz, Joel W.;Li, Rong
通讯作者：
Li, Rong
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Galburt, Eric A.;Grill, Stephan W.;Bustamante, Carlos
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