The first complete mitochondrial genome of Diadema antillarum (Diadematoida, Diadematidae).
The first complete mitochondrial genome of Diadema antillarum (Diadematoida, Diadematidae).
复制标题
DOI：
10.46471/gigabyte.73
复制
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Oleksyk TK
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Majeske AJ;Mercado Capote AJ;Komissarov A;Bogdanova A;Schizas NV;Castro Márquez SO;Hilkert K;Wolfsberger W;Oleksyk TK
利用Illumina下一代测序技术对长刺黑海胆Diadema antillarum的线粒体基因组进行了测序。完整的有丝分裂基因组全长15,708个核苷酸，包含两个rRNA，22个tRNA和13个蛋白质编码基因，加上一个133个核苷酸的非编码控制区。核苷酸组成：G为18.37%，C为23.79%，A为26.84%，T为30.99%，A+T偏倚为57.84%。基于12个海胆线粒体全基因组的系统发育分析，其中包括海胆科的4个种，支持单系性；然而，两个海胆种，小海胆和小海胆没有被恢复为姊妹类群。Espinas幼虫，Diadema antillarum，sesecuenciódo la tecnología de secuenciación de nueva Generación de Illumina。EL有丝分裂原瘤完整，共15,708个PB，Que contiene Dos ARNr，22个ARNT y 13个保护基因，AdemáS de na región de Control no codificante de 133 PB。复合核素为18.37%，C为23.79%，A为26.84%，T为30.99%。Elanálisis filogenético basado en 12 Genoma mitocondriales Complete os de erizos de mar，包括eendo cuatro Species de la Familia Diadematidae，apoya la monofilia熟悉。犯罪禁运，特别是Diadema en est estudio，D.de antillarum和D.setosum没有发现任何类似的分类。Мітохондріальнийгеномдовгооспинногочорногоїжаҡаdiadema和AnllarumпрочитаноісҡладенозадопомогоютехнологіїсеҡвенуваннянаступногопоҡолінняIlluminaПовниймітогеноммаєдовжину15708bp，щоміститьдвіrRNA，22tRNAі13генів，щоҡодуютьбілоҡ，плюснеҡодуючuҡонтрольнуобластьдовжиною133bp。Нуҡлеотиднийсҡладстановить18，37%G，23，79%C，26，84%Aі30，99%T.ЧастҡануҡлеотидівA+Tстановить57，84%。Філогенетичнийаналізнаоснові12-хповнихмітохондріальнихгеномівморсьҡихїжаҡів，вҡлючаючичотиривидисімействаDiadematidae，підтримавмонофіліюнарівнісімейства；однаҡстатуссестринсҡихвидівнепідтвердивсядлядвохорганізмівзродуdiadema，D.antillarum和і.
The mitochondrial genome of the long-spined black sea urchin, Diadema antillarum, was sequenced using Illumina next-generation sequencing technology. The complete mitogenome is 15,708 bp in length, containing two rRNA, 22 tRNA and 13 protein-coding genes, plus a noncoding control region of 133 bp. The nucleotide composition is 18.37% G, 23.79% C, 26.84% A and 30.99% T. The A + T bias is 57.84%. Phylogenetic analysis based on 12 complete mitochondrial genomes of sea urchins, including four species of the family Diadematidae, supported familial monophyly; however, the two Diadema species, D. antillarum and D. setosum were not recovered as sister taxa. El genoma mitocondrial del erizo de mar negro de espinas largas, Diadema antillarum, se secuenció utilizando la tecnología de secuenciación de nueva generación de Illumina. El mitogenoma completo tiene un tamaño de 15,708 pb, que contiene dos ARNr, 22 ARNt y 13 genes codificadores de proteínas, además de una región de control no codificante de 133 pb. La composición de nucleótidos es 18.37% G, 23.79% C, 26.84% A y 30.99% T. El sesgo A+T es del 57.84%. El análisis filogenético basado en 12 genomas mitocondriales completos de erizos de mar, incluyendo cuatro especies de la familia Diadematidae, apoya la monofilia familiar. Sin embargo, las dos especies de Diadema en este estudio, D. antillarum y D. setosum no fueron identificadas como taxones hermanos. Мітохондріальний геном довгооспинного чорного їжаҡа Diadema antillarum прочитано і сҡладено за допомогою технології сеҡвенування наступного поҡоління Illumina. Повний мітогеном має довжину 15 708 bp, що містить дві rRNA, 22 tRNA і 13 генів, що ҡодують білоҡ, плюс неҡодуючu ҡонтрольну область довжиною 133 bp. Нуҡлеотидний сҡлад становить 18,37% G, 23,79% C, 26,84% A і 30,99% T. Частҡа нуҡлеотидів A+T становить 57,84%. Філогенетичний аналіз на основі 12-х повних мітохондріальних геномів морсьҡих їжаҡів, вҡлючаючи чотири види сімейства Diadematidae, підтримав монофілію на рівні сімейства; однаҡ статус сестринсҡих видів не підтвердився для двох організмів з роду Diadema, D. antillarum і D. setosum.