Water-Peptide Dynamics during Conformational Transitions.
Water-Peptide Dynamics during Conformational Transitions.
复制标题
构象转变过程中的水-肽动力学。
DOI：
10.1021/jz400051p
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发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Nerukh D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Nerukh D
使用显式水分子的经典分子动力学模拟研究二肽亚稳态构象之间的转变。转变前不同时刻周围水的分布以及水与肽构象运动的动力学相关性表明，水分子在构象变化期间代表了分子系统的组成部分，这与水和肽动力学基本上解耦的亚稳态时期形成鲜明对比。
Transitions between metastable conformations of a dipeptide are investigated using classical molecular dynamics simulation with explicit water molecules. The distribution of the surrounding water at different moments before the transitions and the dynamical correlations of water with the peptide’s configurational motions indicate that the water molecules represent an integral part of the molecular system during the conformational changes, in contrast with the metastable periods when water and peptide dynamics are essentially decoupled.
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