A 10-year meta-analysis of membrane protein structural biology: Detergents, membrane mimetics, and structure determination techniques.
A 10-year meta-analysis of membrane protein structural biology: Detergents, membrane mimetics, and structure determination techniques.
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膜蛋白结构生物学的10年荟萃分析：洗涤剂，膜模拟物和结构测定技术。
DOI：
10.1016/j.bbamem.2020.183533
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发表时间：
2021-03-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Pryor EE Jr
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Choy BC;Cater RJ;Mancia F;Pryor EE Jr
膜蛋白的结构测定对于许多生命过程的分子理解是至关重要的，但它在历史上一直是一个技术上具有挑战性的奋进。在过去的十年中，出现了许多技术进步，技术和试剂，促进了膜蛋白结构生物学，导致越来越多的膜蛋白结构确定。为了整理这些进展，我们挖掘了现有文献，分析了2010-2019年所有独特解决的膜蛋白结构的纯化和结构测定细节。我们的分析表明，单粒子冷冻电子显微镜的强大影响，并说明了这种技术如何影响洗涤剂和膜模拟使用。此外，我们详细介绍了如何不同的结构确定方法，分类结构域和蛋白质类具有独特的去污剂/膜模拟配置文件，突出定制其选择的重要性。我们的分析提供了膜蛋白结构生物学领域的定量概述，以及它如何随着时间的推移而发展。我们预计，这些将作为一个有用的工具，以简化未来的膜蛋白结构的测定，通过指导选择洗涤剂/膜模拟。
Structure determination of membrane proteins is critical to the molecular understanding of many life processes, yet it has historically been a technically challenging endeavor. This past decade has given rise to a number of technological advancements, techniques, and reagents, which have facilitated membrane protein structural biology, resulting in an ever-growing number of membrane protein structures determined. To collate these advances, we have mined available literature to analyze the purification and structure determination specifics for all uniquely solved membrane protein structures from 2010-2019. Our analyses demonstrate the strong impact of single-particle cryo-electron microscopy on the field and illustrate how this technique has affected detergent and membrane mimetic usage. Furthermore, we detail how different structure determination methods, taxonomic domains and protein classes have unique detergent/membrane mimetic profiles, highlighting the importance of tailoring their selection. Our analyses provide a quantitative overview of where the field of membrane protein structural biology stands and how it has developed over time. We anticipate that these will serve as a useful tool to streamline future membrane protein structure determination by guiding the choice of detergent/membrane mimetic.
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影响因子：
3.4
作者：
Liu, Wei;Hanson, Michael A.;Cherezov, Vadim
通讯作者：
Cherezov, Vadim
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62.1
作者：
Chipot C;Dehez F;Schnell JR;Zitzmann N;Pebay-Peyroula E;Catoire LJ;Miroux B;Kunji ERS;Veglia G;Cross TA;Schanda P
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Schanda P
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21.1
作者：
He, Yuan;Wang, Kan;Yan, Nieng
通讯作者：
Yan, Nieng
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Frauenfeld J;Löving R;Armache JP;Sonnen AF;Guettou F;Moberg P;Zhu L;Jegerschöld C;Flayhan A;Briggs JA;Garoff H;Löw C;Cheng Y;Nordlund P
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Nordlund P
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4.3
作者：
Chae, Pil Seok;Rasmussen, Soren G. F.;Rana, Rohini R.;Gotfryd, Kamil;Kruse, Andrew C.;Manglik, Aashish;Cho, Kyung Ho;Nurva, Shailika;Gether, Ulrik;Guan, Lan;Loland, Claus J.;Byrne, Bernadette;Kobilka, Brian K.;Gellman, Samuel H.
通讯作者：
Gellman, Samuel H.