Cellular microRNA networks regulate host dependency of hepatitis C virus infection.
Cellular microRNA networks regulate host dependency of hepatitis C virus infection.
复制标题
DOI：
10.1038/s41467-017-01954-x
复制
发表时间：
2017-11-27
影响因子：
16.6
通讯作者：
Liang TJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Li Q;Lowey B;Sodroski C;Krishnamurthy S;Alao H;Cha H;Chiu S;El-Diwany R;Ghany MG;Liang TJ
细胞microRNA（miRNAs）已被证明可以调节丙型肝炎病毒（HCV）的复制，但目前还缺乏对影响HCV生命周期的miRNAs库的系统研究。在这里，我们应用整合功能基因组学策略来阐明全球HCV-miRNA相互作用。通过全基因组miRNA模拟物和发夹抑制剂表型筛选，以及miRNA-mRNA转录组学分析，我们确定了与HCV相互作用的三种前病毒和九种抗病毒miRNA。这些miRNA在功能上与HCV生命周期的特定步骤和相关的病毒宿主依赖性相关。进一步的机制研究表明，miR-25、let-7和miR-130家族抑制HCV必需的辅因子，从而在多个阶段限制病毒感染。HCV通过抑制它们在细胞培养模型和HCV感染的人类肝脏中的表达来破坏这些miRNA的抗病毒作用。这一全面的HCV-miRNA相互作用图谱为HCV介导的发病机制提供了基本见解，并揭示了将RNA生物学与病毒感染联系起来的分子途径。利用全基因组miRNA模拟物和发夹抑制剂筛选，Li等人鉴定了31种在病毒生命周期的不同阶段抑制或促进丙型肝炎病毒（HCV）复制的miRNA。此外，人类肝脏活检显示，HCV下调了已识别的具有抗病毒功能的miRNA。
Cellular microRNAs (miRNAs) have been shown to regulate hepatitis C virus (HCV) replication, yet a systematic interrogation of the repertoire of miRNAs impacting HCV life cycle is lacking. Here we apply integrative functional genomics strategies to elucidate global HCV–miRNA interactions. Through genome-wide miRNA mimic and hairpin inhibitor phenotypic screens, and miRNA–mRNA transcriptomics analyses, we identify three proviral and nine antiviral miRNAs that interact with HCV. These miRNAs are functionally linked to particular steps of HCV life cycle and related viral host dependencies. Further mechanistic studies demonstrate that miR-25, let-7, and miR-130 families repress essential HCV co-factors, thus restricting viral infection at multiple stages. HCV subverts the antiviral actions of these miRNAs by dampening their expression in cell culture models and HCV-infected human livers. This comprehensive HCV–miRNA interaction map provides fundamental insights into HCV-mediated pathogenesis and unveils molecular pathways linking RNA biology to viral infections. Using genome-wide miRNA mimic and hairpin inhibitor screens, Li et al. identify 31 miRNAs that either inhibit or promote hepatitis C virus (HCV) replication at different steps of the viral life cycle. Furthermore, human liver biopsies show that HCV down-regulates identified miRNAs with antiviral function.
登录
查看更多内容
影响因子：
82.9
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
5.4
作者：
Kato, Takanobu;Matsumura, Takuya;Liang, T. Jake
通讯作者：
Liang, T. Jake
影响因子：
82.9
作者：
Jarret A;McFarland AP;Horner SM;Kell A;Schwerk J;Hong M;Badil S;Joslyn RC;Baker DP;Carrington M;Hagedorn CH;Gale M Jr;Savan R
通讯作者：
Savan R
通过靶向 IGF2BP1，对α干扰素和白细胞介素 28B 调节的 MicroRNA 进行高通量分析，并鉴定具有抗丙型肝炎病毒活性的 let-7
影响因子：
5.4
作者：
Cheng, Min;Si, Youhui;Yang, Wei
通讯作者：
Yang, Wei
DOI：
10.1126/science.1178178
发表时间：
2010-01-08
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Lanford RE;Hildebrandt-Eriksen ES;Petri A;Persson R;Lindow M;Munk ME;Kauppinen S;Ørum H
通讯作者：
Ørum H