HGVbaseG2P: a central genetic association database.
HGVbaseG2P: a central genetic association database.
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DOI：
10.1093/nar/gkn748
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发表时间：
2009-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Brookes AJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Thorisson GA;Lancaster O;Free RC;Hastings RK;Sarmah P;Dash D;Brahmachari SK;Brookes AJ
人类基因组从基因型到表型信息的变异数据库(HGVbase G2P)是一个新的中央数据库，用于从大到小的人类遗传关联研究的总结水平的发现。需要这样一个数据库，以便研究人员能够轻松地访问与他们的基因、基因组区域或感兴趣的疾病相关的所有可用的关联研究数据。这样的储存库将使真阳性信号更容易与不能一致复制的假阳性(I类错误)区分开来。在本文中，我们描述了HGVbase G2P是如何构建的，以及它的数据是如何收集和组织的。我们提供了一系列用户友好但功能强大的网站工具，用于搜索、浏览和可视化G2P研究结果。HGVbase G2P可在http://www.hgvbaseg2p.org.上获得
The Human Genome Variation database of Genotype to Phenotype information (HGVbaseG2P) is a new central database for summary-level findings produced by human genetic association studies, both large and small. Such a database is needed so that researchers have an easy way to access all the available association study data relevant to their genes, genome regions or diseases of interest. Such a depository will allow true positive signals to be more readily distinguished from false positives (type I error) that fail to consistently replicate. In this paper we describe how HGVbaseG2P has been constructed, and how its data are gathered and organized. We present a range of user-friendly but powerful website tools for searching, browsing and visualizing G2P study findings. HGVbaseG2P is available at http://www.hgvbaseg2p.org.
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