Bringing Open Data to Whole Slide Imaging.
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DOI：
10.1007/978-3-030-23937-4_1
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发表时间：
2019-04-01
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Swedlow, Jason R
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Besson, Sebastien;Leigh, Roger;Swedlow, Jason R
面对支持越来越多的全载玻片成像（WSI）文件格式的需求，我们的团队扩展了一种长期使用的社区文件格式（OME-TIFF），用于数字病理学。该格式利用核心TIFF规范以灵活、高性能的方式存储单个幻灯片的多分辨率（或“金字塔”）表示。在这里，我们描述了这种格式的结构，它的性能特点，以及一个开源库支持阅读和写入金字塔OME-TIFF。
Faced with the need to support a growing number of whole slide imaging (WSI) file formats, our team has extended a long-standing community file format (OME-TIFF) for use in digital pathology. The format makes use of the core TIFF specification to store multi-resolution (or "pyramidal") representations of a single slide in a flexible, performant manner. Here we describe the structure of this format, its performance characteristics, as well as an open-source library support for reading and writing pyramidal OME-TIFFs.