Protein Data Bank Japan (PDBj): maintaining a structural data archive and resource description framework format.
Protein Data Bank Japan (PDBj): maintaining a structural data archive and resource description framework format.
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DOI：
10.1093/nar/gkr811
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发表时间：
2012-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Nakamura H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kinjo AR;Suzuki H;Yamashita R;Ikegawa Y;Kudou T;Igarashi R;Kengaku Y;Cho H;Standley DM;Nakagawa A;Nakamura H
日本蛋白质数据库（PDBj，http://pdbj.org）是全球蛋白质数据库（wwPDB）的成员，接受并处理实验确定的大分子结构的存储数据。在与其他wwPDB合作伙伴合作维护档案的同时，PDBj还提供了广泛的服务和工具，用于分析蛋白质的结构和功能，本文对此进行了总结。为了增强PDB数据的互操作性，我们最近开发了PDB/RDF，资源描述框架（RDF）格式的PDB数据，沿着基于PDB mmCIF交换字典的Web本体语言（OWL）中的本体。作为语义网的标准格式，PDB/RDF数据提供了一种将PDB与其他生物信息资源集成的方法。
The Protein Data Bank Japan (PDBj, http://pdbj.org) is a member of the worldwide Protein Data Bank (wwPDB) and accepts and processes the deposited data of experimentally determined macromolecular structures. While maintaining the archive in collaboration with other wwPDB partners, PDBj also provides a wide range of services and tools for analyzing structures and functions of proteins, which are summarized in this article. To enhance the interoperability of the PDB data, we have recently developed PDB/RDF, PDB data in the Resource Description Framework (RDF) format, along with its ontology in the Web Ontology Language (OWL) based on the PDB mmCIF Exchange Dictionary. Being in the standard format for the Semantic Web, the PDB/RDF data provide a means to integrate the PDB with other biological information resources.
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影响因子：
5.8
作者：
Kinoshita, K;Nakamura, H
通讯作者：
Nakamura, H
影响因子：
8
作者：
Kinoshita, K;Nakamura, H
通讯作者：
Nakamura, H
影响因子：
64.8
作者：
Fujii, Takashi;Iwane, Atsuko H.;Namba, Keiichi
通讯作者：
Namba, Keiichi
影响因子：
9.5
作者：
Good, Benjamin M.;Wilkinson, Mark D.
通讯作者：
Wilkinson, Mark D.
DOI：
10.2142/biophysics.1.67
发表时间：
2005
期刊：
Biophysics (Nagoya-shi, Japan)
影响因子：
--
作者：
Kinjo AR;Nishikawa K
通讯作者：
Nishikawa K