草地早熟禾水通道蛋白基因cDNA克隆及序列特征分析
草地早熟禾水通道蛋白基因cDNA克隆及序列特征分析
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DOI：
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发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
宋航
中科院分区：
文献类型：
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作者：
陈雅君;王艳彬;谢福春;秦立刚;张璐;李静静;王昕慧;宋航
利用RT-PCR和RACE技术克隆草地早熟禾水通道蛋白PpTIP2基因，并对其序列特征进行分析，目的是为进一步揭示水通道蛋白在草地早熟禾细胞中水分代谢和运转的功能及为培育节水抗旱新品种提供分子生物学依据。克隆获得的PpTIP2的cDNA全长有1134bp，包含了一个750bp完整阅读框架，5'末端非翻译区76bp和3'末端非翻译区308bp。该基因编码一个由249个氨基酸残基组成的蛋白质，分子量为25.19kD，预测的等电点是5.58。生物信息学分析表明，草地早熟禾PpTIP2基因具有MIP家族的信号序列SGXHXNPAVT特征，同时具有水通道蛋白典型的6个跨膜区和2个Asn-Pro-Ala单元。通过同源性比对分析，PpTIP2属于TIP2亚家族成员。