A genome-wide siRNA screen reveals diverse cellular processes and pathways that mediate genome stability.
A genome-wide siRNA screen reveals diverse cellular processes and pathways that mediate genome stability.
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DOI：
10.1016/j.molcel.2009.06.021
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发表时间：
2009-07-31
期刊：
影响因子：
16
通讯作者：
Cimprich, Karlene A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Paulsen, Renee D.;Soni, Deena V.;Wollman, Roy;Hahn, Angela T.;Yee, Muh-Ching;Guan, Anna;Hesley, Jayne A.;Miller, Steven C.;Cromwell, Evan F.;Solow-Cordero, David E.;Meyer, Tobias;Cimprich, Karlene A.
对 DNA 损伤作出反应的信号通路对于维持基因组稳定性至关重要，并且与包括癌症在内的许多疾病有关。在这里，采用全基因组 siRNA 筛选，通过监测组蛋白变体 H2AX 的磷酸化（DNA 损伤的早期标志）来识别参与基因组稳定的新基因。我们鉴定了数百个基因，其下调导致 H2AX 磷酸化 (γH2AX) 水平升高，并揭示了与细胞复合物和具有未分类功能的基因的新联系。我们证明了 mRNA 加工因子在防止 DNA 损伤中发挥着广泛的作用，在某些情况下，DNA 损伤是由异常的 RNA-DNA 结构引起的。此外，我们将增加的 γH2AX 水平与神经系统疾病、腓骨肌萎缩症 (CMT) 综合征联系起来，并且我们发现了几种 CMT 蛋白在 DNA 损伤反应中的作用。这些数据表明，基因组稳定性的保持是由比以前认识的更大的生物过程网络介导的。
Signaling pathways that respond to DNA damage are essential for the maintenance of genome stability and are linked to many diseases, including cancer. Here, a genome-wide siRNA screen was employed to identify novel genes involved in genome stabilization by monitoring phosphorylation of the histone variant H2AX, an early mark of DNA damage. We identified hundreds of genes whose down-regulation led to elevated levels of H2AX phosphorylation (γH2AX) and revealed new links to cellular complexes and to genes with unclassified functions. We demonstrate a widespread role for mRNA processing factors in preventing DNA damage, which in some cases is caused by aberrant RNA-DNA structures. Furthermore, we connect increased γH2AX levels to the neurological disorder, Charcot-Marie-Tooth (CMT) syndrome, and we find a role for several CMT proteins in the DNA damage response. These data indicate that preservation of genome stability is mediated by a larger network of biological processes than previously appreciated.
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影响因子：
16
作者：
Chowdhury, Dipanjan;Xu, Xingzhi;Zhong, Xueyan;Ahmed, Fariyal;Zhong, Jianing;Liao, Ji;Dykxhoorn, Derek M.;Weinstock, David M.;Pfeifer, Gerd P.;Lieberman, Judy
通讯作者：
Lieberman, Judy
影响因子：
64.8
作者：
Bartkova, J;Horejsi, Z;Bartek, J
通讯作者：
Bartek, J
影响因子：
64.8
作者：
Bartkova, Jirina;Rezaei, Nousin;Gorgoulis, Vassilis G.
通讯作者：
Gorgoulis, Vassilis G.
影响因子：
64.8
作者：
Di Micco, Raffaella;Fumagalli, Marzia;di Fagagna, Fabrizio d'Adda
通讯作者：
di Fagagna, Fabrizio d'Adda
影响因子：
64.5
作者：
Li, XL;Manley, JL
通讯作者：
Manley, JL