Identifiers for the 21st century: How to design, provision, and reuse persistent identifiers to maximize utility and impact of life science data
Identifiers for the 21st century: How to design, provision, and reuse persistent identifiers to maximize utility and impact of life science data
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21 世纪的标识符：如何设计、提供和重用持久标识符以最大限度地提高生命科学数据的效用和影响
DOI：
10.1101/117812
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
McMurry J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
McMurry J
在许多学科中，数据高度分散在数千个在线数据库（存储库，注册表和知识库）中。从这样的数据库中获得价值取决于数据科学的学科和使集成成为可能的不起眼的砖块和灰泥;标识符是这种集成基础设施的核心组件。根据我们的经验和其他小组的工作，我们概述了10个经验教训，我们学到的标识符的质量和最佳实践，促进大规模数据集成。具体而言，我们提出了标识符从业者（数据库提供商）在设计，提供和重用标识符时应采取的行动。我们还概述了在各种情况下引用标识符的重要考虑因素，包括作者和数据生成器。虽然每个经验教训的重要性和相关性因情况而异，但需要提高对如何避免和管理共同标识符问题的认识，特别是与持久性和网络可访问性/可解决性有关的问题。我们强烈关注生命科学中基于网络的标识符;然而，这些原则与其他学科广泛相关。
In many disciplines, data are highly decentralized across thousands of online databases (repositories, registries, and knowledgebases). Wringing value from such databases depends on the discipline of data science and on the humble bricks and mortar that make integration possible; identifiers are a core component of this integration infrastructure. Drawing on our experience and on work by other groups, we outline 10 lessons we have learned about the identifier qualities and best practices that facilitate large-scale data integration. Specifically, we propose actions that identifier practitioners (database providers) should take in the design, provision and reuse of identifiers. We also outline the important considerations for those referencing identifiers in various circumstances, including by authors and data generators. While the importance and relevance of each lesson will vary by context, there is a need for increased awareness about how to avoid and manage common identifier problems, especially those related to persistence and web-accessibility/resolvability. We focus strongly on web-based identifiers in the life sciences; however, the principles are broadly relevant to other disciplines.
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