Viral channel forming proteins - modeling the target.
Viral channel forming proteins - modeling the target.
复制标题
病毒通道形成蛋白质 - 对靶标进行建模。
DOI：
10.1016/j.bbamem.2010.05.014
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发表时间：
2011-03
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Hsu HJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fischer WB;Hsu HJ
细胞和亚细胞膜遇到了病毒编码的膜蛋白活动的重要场所。病毒膜蛋白与其宿主同伴相似，可以是膜的一部分或附着在膜上。它们参与指导细胞和病毒的繁殖、融合和出芽过程。这篇综述特别关注那些形成通道或孔的完整病毒膜蛋白、分类、计算机模拟方法和潜在的候选药物。 HIV-1 Vpu 分离物的序列与宿主离子通道和毒素进行比对。重点是跨膜域的对齐。比对结果被映射到各个通道和毒素的 3D 结构上。映射结果支持 Vpu 的“通道-孔隙二元论”的想法。
The cellular and subcellular membranes encounter an important playground for the activity of membrane proteins encoded by viruses. Viral membrane proteins, similar to their host companions, can be integral or attached to the membrane. They are involved in directing the cellular and viral reproduction, the fusion and budding processes. This review focuses especially on those integral viral membrane proteins which form channels or pores, the classification to be so, modeling by in silico methods and potential drug candidates. The sequence of an isolate of Vpu from HIV-1 is aligned with host ion channels and a toxin. The focus is on the alignment of the transmembrane domains. The results of the alignment are mapped onto the 3D structures of the respective channels and toxin. The results of the mapping support the idea of a ‘channel–pore dualism’ for Vpu.
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