MutDB services: interactive structural analysis of mutation data.
MutDB services: interactive structural analysis of mutation data.
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MUTDB服务：突变数据的互动结构分析。
DOI：
10.1093/nar/gki404
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发表时间：
2005-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Mooney, S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Dantzer, J;Moad, C;Heiland, R;Mooney, S
非同义单核苷酸多态性（SNP）和突变与人类表型和疾病有关。随着越来越多的SNP被映射到表型，了解这些变异如何影响基因和基因产物的功能和表达成为一项重要的奋进。我们已经开发了一套工具来帮助理解氨基酸取代如何影响蛋白质结构。为此，我们在dbSNP中注释了SNP，并在Swiss-Prot中用蛋白质结构信息（如果可用）注释了氨基酸取代。然后，我们开发了一个新的网络界面，这些数据，允许可视化的位置，这些取代。我们还开发了数据集的Web服务接口，并为UCSF的Chimera结构建模工具和PyMOL开发了交互式插件，将我们的注释与这些复杂的结构可视化和建模工具集成在一起。Web服务门户和插件可从下载，Web界面位于。
Non-synonymous single nucleotide polymorphisms (SNPs) and mutations have been associated with human phenotypes and disease. As more and more SNPs are mapped to phenotypes, understanding how these variations affect the function and expression of genes and gene products becomes an important endeavor. We have developed a set of tools to aid in the understanding of how amino acid substitutions affect protein structures. To do this, we have annotated SNPs in dbSNP and amino acid substitutions in Swiss-Prot with protein structural information, if available. We then developed a novel web interface to this data that allows for visualization of the location of these substitutions. We have also developed a web service interface to the dataset and developed interactive plugins for UCSF's Chimera structural modeling tool and PyMOL that integrate our annotations with these sophisticated structural visualization and modeling tools. The web services portal and plugins can be downloaded from and the web interface is at .
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