A Versatile Structural Domain Analysis Server Using Profile Weight Matrices
A Versatile Structural Domain Analysis Server Using Profile Weight Matrices
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使用轮廓权重矩阵的多功能结构域分析服务器
DOI：
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发表时间：
2002
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
T. Dandekar
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Steffen Schmidt;P. Bork;T. Dandekar
WEB工具“AnDom”将给定的蛋白质序列分配给其中包含的所有实验确定的结构域，包括多结构域和大蛋白质。服务器使用来自所有已知SCOP结构域（SCOP版本1.50）的定制生成的多序列比对的配置文件特定矩阵。预测时间很短，允许许多结构基因组学的应用，包括复杂的真核蛋白质家族的调查。WWW服务器位于http：//www.bork.embl-heidelberg.de/AnDom，配置文件可从ftp.bork.embl-heidelberg.de/pub/users/施密特/AnDom下载。
The WEB tool "AnDom" assigns to a given protein sequence all experimentally determined structural domains contained within it, including multidomain and large proteins. The server uses profile specific matrices from custom generated multiple sequence alignments of all known SCOP domains (SCOP version 1.50). Prediction time is short allowing numerous applications for structural genomics including investigation of complex eucaryotic protein families. The WWW server is at http://www.bork.embl-heidelberg.de/AnDom, and profiles can be downloaded at ftp.bork.embl-heidelberg.de/pub/users/ schmidt/AnDom.
影响因子：
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作者：
PotentialsbyNickolai N. Alexandrov;R. Nussinov;Ralf M. Zimmer
通讯作者：
PotentialsbyNickolai N. Alexandrov;R. Nussinov;Ralf M. Zimmer