A eubacterial riboswitch class that senses the coenzyme tetrahydrofolate.
A eubacterial riboswitch class that senses the coenzyme tetrahydrofolate.
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DOI：
10.1016/j.chembiol.2010.05.020
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发表时间：
2010-07-30
影响因子：
--
通讯作者：
Breaker RR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ames TD;Rodionov DA;Weinberg Z;Breaker RR
细菌基因组的比较序列分析揭示了许多作为代谢物结合核糖开关的结构化RNA基序。我们在Firmicut基因组中发现了一个RNA基序，该基序经常位于叶酸运输和生物合成基因的5‘UTRs中。生化实验证实，这一新发现的RNA类别的代表选择性地结合维生素叶酸的衍生物，包括二氢叶酸辅酶和四氢叶酸辅酶。此外，这个适体类的代表偶尔驻留在RNA结构的上游，这些结构被预测为控制翻译起始以响应配体结合。这些发现扩大了由RNA直接感受到的辅酶的数量，并揭示了可能的核糖开关控制的调节因子，它们对单碳代谢的变化做出反应。
Comparative sequence analyses of bacterial genomes are revealing many structured RNA motifs that function as metabolite-binding riboswitches. We have identified an RNA motif frequently positioned in the 5′ UTRs of folate transport and biosynthesis genes in Firmicute genomes. Biochemical experiments confirm that representatives of this newfound RNA class selectively bind derivatives of the vitamin folate, including di- and tetrahydrofolate coenzymes. In addition, representatives of this aptamer class occasionally reside upstream of RNA structures that are predicted to control translation initiation in response to ligand binding. These findings expand the number of coenzymes that are directly sensed by RNA and reveal possible riboswitch-controlled regulons that respond to changes in single-carbon metabolism.
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