The Stanford Microarray Database: implementation of new analysis tools and open source release of software.
The Stanford Microarray Database: implementation of new analysis tools and open source release of software.
复制标题
斯坦福微阵列数据库：新分析工具的实现和软件的开源发布。
DOI：
10.1093/nar/gkl1019
复制
发表时间：
2007-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Ball, Catherine A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Demeter, Janos;Beauheim, Catherine;Gollub, Jeremy;Hernandez-Boussard, Tina;Jin, Heng;Maier, Donald;Matese, John C.;Nitzberg, Michael;Wymore, Farrell;Zachariah, Zachariah K.;Brown, Patrick O.;Sherlock, Gavin;Ball, Catherine A.
Stanford MicroArray数据库（SMD;）是一种研究工具和档案，它允许全球数百名研究人员存储，注释，分析和共享MicroArray Technology生成的数据。 SMD支持大多数主要的微阵列平台，并且是迈阿密支持的，可以出口或进口Mage-ML。 SMD的主要任务是成为一种研究工具，该工具从数据生成到数据出版物和传播的研究人员都为研究人员提供支持，但它也提供了对来自300个出版物的分析工具和公共数据的不受限制访问。除了支持正在进行的研究外，SMD还根据开源许可使其他人完全自由地提供其源代码，从而使其他小组能够创建SMD的本地安装。在本文中，我们描述了SMD中实施的几种数据分析工具，并讨论了软件发布的功能。
The Stanford Microarray Database (SMD; ) is a research tool and archive that allows hundreds of researchers worldwide to store, annotate, analyze and share data generated by microarray technology. SMD supports most major microarray platforms, and is MIAME-supportive and can export or import MAGE-ML. The primary mission of SMD is to be a research tool that supports researchers from the point of data generation to data publication and dissemination, but it also provides unrestricted access to analysis tools and public data from 300 publications. In addition to supporting ongoing research, SMD makes its source code fully and freely available to others under an Open Source license, enabling other groups to create a local installation of SMD. In this article, we describe several data analysis tools implemented in SMD and we discuss features of our software release.
登录
查看更多内容
影响因子：
3
作者：
Killion PJ;Sherlock G;Iyer VR
通讯作者：
Iyer VR
影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
DOI：
10.1073/pnas.97.18.10101
发表时间：
2000-08-29
影响因子：
11.1
作者：
Alter, O;Brown, PO;Botstein, D
通讯作者：
Botstein, D
影响因子：
5.8
作者：
Troyanskaya, O;Cantor, M;Altman, RB
通讯作者：
Altman, RB
影响因子：
14.9
作者：
Gollub, J;Ball, CA;Sherlock, G
通讯作者：
Sherlock, G