颞叶癫痫microRNA基因甲基化模式分析及机制探究
颞叶癫痫microRNA基因甲基化模式分析及机制探究
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DOI：
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
肖波
中科院分区：
文献类型：
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作者：
龙泓羽;肖文彪;吴龑昊;罗朝辉;肖波
目的 重注释甲基化数据并构建microRNA(miRNA)基因甲基化谱，探究差异甲基化miRNA在颞叶癫痫(TLE)发生发展及耐药机制中的作用。方法 收集TLE患者以及健康对照外周血，提取DNA进行全基因组DNA甲基化检测。将甲基化数据重注释至miRNA基因，统计分析筛选病例组与对照组以及临床亚组之间的差异甲基化miRNA，运用生物信息学方法对差异甲基化miRNA功能分析。结果TLE和对照组间有82个miRNA基因甲基化存在差异(FDR＜5%)，其中甲基化升高的70个。临床亚组间也存在差异甲基化miRNA基因(P＜0.01)。差异甲基化miRNA基因参与MAPK信号通路、神经营养信号通路等多条生物学通路。结论 TLE患者外周血miRNA基因组甲基化存在异常，以甲基化程度升高为主。差异甲基化miRNA基因参与多条生物学通路，可能在TLE发病及耐药机制中起到重要作用。