毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
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DOI：
10.11833/j.issn.2095-0756.2019.05.010
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发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
徐芷馨
中科院分区：
文献类型：
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作者：
蒋政勤;周明兵;郑浩;季航;徐芷馨
长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7。该转座子全长为6 073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支, LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前。对毛竹实生苗分别进行辐照(30, 50, 70 Gy),甲基化抑制剂(50, 100, 150 μmol·L~(-1)),高温(42 ℃),低温(4 ℃),高盐(0.1, 0.2, 0.3 mol·L~(-1))等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应(PCR)检测, PHRE7在INT, RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2~0.3 mol·L~(-1)高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、高温、低温、高盐0.1~0.2 mol·L~(-1))的表达量都随处理强度呈上升趋势。这些结果表明: PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化。