Oligomerized pool engineering (OPEN): an 'open-source' protocol for making customized zinc-finger arrays.
Oligomerized pool engineering (OPEN): an 'open-source' protocol for making customized zinc-finger arrays.
复制标题
DOI：
10.1038/nprot.2009.98
复制
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
14.8
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
工程化的锌指核酸酶（ZFN）形成了用于真核基因组的靶向、有效修饰的广泛适用的方法的基础。在最近的工作中，我们描述了OPEN（寡聚池工程），这是一种“开源”的基于组合选择的方法，用于设计功能良好的锌指阵列。我们还在直接比较中表明，OPEN方法具有比先前描述的用于工程化ZFN的“模块化组装”方法更高的成功率。在E中执行OPEN选择。大肠杆菌使用细菌双杂交系统，不需要专门的设备。在这里，我们提供了一个详细的协议，用于执行开放工程锌指阵列，具有很高的概率作为ZFN。使用OPEN，研究人员可以在大约8周内生成多个定制的ZFN。
Engineered zinc finger nucleases (ZFNs) form the basis of a broadly applicable method for targeted, efficient modification of eukaryotic genomes. In recent work, we described OPEN (Oligomerized Pool ENgineering), an “open-source,” combinatorial selection-based method for engineering zinc finger arrays that function well as ZFNs. We have also shown in direct comparisons that the OPEN method has a higher success rate than previously described “modular assembly” methods for engineering ZFNs. OPEN selections are performed in E. coli using a bacterial two-hybrid system and do not require specialized equipment. Here we provide a detailed protocol for performing OPEN to engineer zinc finger arrays that have a high probability of functioning as ZFNs. Using OPEN, researchers can generate multiple customized ZFNs in approximately 8 weeks.
登录
查看更多内容
影响因子：
5.1
作者：
Cai, Charles Q.;Doyon, Yannick;Petolino, Joseph F.
通讯作者：
Petolino, Joseph F.
影响因子：
12.4
作者：
Alwin, S;Gere, MB;Cathomen, T
通讯作者：
Cathomen, T
影响因子：
2.9
作者：
Isalan, M;Klug, A;Choo, Y
通讯作者：
Choo, Y
影响因子：
5.4
作者：
Eberhardy, SR;Goncalves, J;Barbas, CF
通讯作者：
Barbas, CF
DOI：
10.1073/pnas.040552697
发表时间：
2000-02-15
影响因子：
11.1
作者：
Beerli, RR;Dreier, B;Barbas, CF
通讯作者：
Barbas, CF