A functional genomic approach identifies FAL1 as an oncogenic long noncoding RNA that associates with BMI1 and represses p21 expression in cancer.
A functional genomic approach identifies FAL1 as an oncogenic long noncoding RNA that associates with BMI1 and represses p21 expression in cancer.
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DOI：
10.1016/j.ccr.2014.07.009
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发表时间：
2014-09-08
期刊：
影响因子：
50.3
通讯作者：
Zhang L
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hu X;Feng Y;Zhang D;Zhao SD;Hu Z;Greshock J;Zhang Y;Yang L;Zhong X;Wang LP;Jean S;Li C;Huang Q;Katsaros D;Montone KT;Tanyi JL;Lu Y;Boyd J;Nathanson KL;Li H;Mills GB;Zhang L
在对来自12种癌症类型的2，394个肿瘤标本中长链非编码RNA（lncRNA）的体细胞拷贝数改变（SCNA）进行的全基因组调查中，我们发现约21.8%的lncRNA基因位于具有局灶性SCNA的区域。通过整合lncRNA SCNAs和表达的生物信息学分析与功能筛选试验，我们确定了一个癌基因，1号染色体上的局灶扩增lncRNA（Focally Amplified lncRNA on Chromosome 1，CX1），其拷贝数和表达与卵巢癌的预后相关。CDKN1与表观遗传阻遏物BMI1结合并调节其稳定性，以调节包括CDKN1A在内的许多基因的转录。p21的致癌活性部分归因于其对p21的抑制。在体内，siRNA特异性抑制肿瘤生长。
In a genome-wide survey on somatic copy number alterations (SCNAs) of long non-coding RNA (lncRNA) in 2,394 tumor specimens from 12 cancer types, we found that about 21.8% of lncRNA genes were located in regions with focal SCNAs. By integrating bioinformatics analyses of lncRNA SCNAs and expression with functional screening assays, we identified an oncogene, Focally Amplified lncRNA on Chromosome 1 (FAL1), whose copy number and expression are correlated with outcomes in ovarian cancer. FAL1 associates with the epigenetic repressor BMI1 and regulates its stability in order to modulate the transcription of a number of genes including CDKN1A. The oncogenic activity of FAL1 is partially attributable to its repression of p21. FAL1-specific siRNAs significantly inhibit tumor growth in vivo.
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影响因子：
64.5
作者：
Huarte M;Guttman M;Feldser D;Garber M;Koziol MJ;Kenzelmann-Broz D;Khalil AM;Zuk O;Amit I;Rabani M;Attardi LD;Regev A;Lander ES;Jacks T;Rinn JL
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Rinn JL
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