The reweighted path ensemble.

The reweighted path ensemble.
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重新加权的路径集成。

DOI:
--
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发表时间:
2010
影响因子:
4.4
通讯作者:
P. Bolhuis
P. Bolhuis
中科院分区:
化学2区
文献类型:
--
作者:
J. Rogal;W. Lechner;J. Juraszek;B. Ensing;P. Bolhuis

文献摘要

参考文献

被引文献

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我们介绍了一个重新加权计划的过渡接口采样框架中的路径集成。重新加权允许分析自由能景观和任何集体变量空间中的提交者预测。我们说明了一个二维的潜在的非线性反应坐标和一个更现实的模拟色氨酸笼折叠过程的重加权计划。我们建议可以使用重新加权的路径系综来优化可能的非线性反应坐标。
We introduce a reweighting scheme for the path ensembles in the transition interface sampling framework. The reweighting allows for the analysis of free energy landscapes and committor projections in any collective variable space. We illustrate the reweighting scheme on a two dimensional potential with a nonlinear reaction coordinate and on a more realistic simulation of the Trp-cage folding process. We suggest that the reweighted path ensemble can be used to optimize possible nonlinear reaction coordinates.
DOI: 10.1063/1.1818091
发表时间: 2005-01-01
影响因子: 4.4
作者:
Berezhkovskii, A;Szabo, A
通讯作者: Szabo, A