Managing large SNP datasets with SNPpy.
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DOI：
10.1007/978-1-62703-447-0_4
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发表时间：
2013-01-01
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
Mitha, Faheem
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Mitha, Faheem
使用关系数据库来管理SNP数据集是一种非常有用的技术，与其他方法相比具有显著的优势，包括利用关系数据库的功能来执行数据验证的能力，以及使用强大的SQL查询语言来导出数据。SNPpy是一个Python程序，它使用PostgreSQL数据库和SQLAlchemy Python库来自动化SNP数据管理。本章介绍如何使用SNPpy存储和管理大型数据集。
Using relational databases to manage SNP datasets is a very useful technique that has significant advantages over alternative methods, including the ability to leverage the power of relational databases to perform data validation, and the use of the powerful SQL query language to export data. SNPpy is a Python program which uses the PostgreSQL database and the SQLAlchemy Python library to automate SNP data management. This chapter shows how to use SNPpy to store and manage large datasets.