Fully automated cellular-resolution vertebrate screening platform with parallel animal processing.
Fully automated cellular-resolution vertebrate screening platform with parallel animal processing.
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DOI：
10.1039/c1lc20849g
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发表时间：
2012-02-21
期刊：
影响因子：
6.1
通讯作者：
Yanik MF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Chang TY;Pardo-Martin C;Allalou A;Wählby C;Yanik MF
斑马鱼幼虫是一种光学透明的脊椎动物模型，具有复杂的器官，广泛用于研究遗传学、发育生物学和模拟各种人类疾病。在本文中，我们提出了一组新技术，可显着提高先前描述的脊椎动物自动筛选技术（VAST）的通量和能力。我们开发了一个强大的多线程系统，可以同时处理多个动物。系统吞吐量仅受图像采集速度的限制，而不受流体或机械过程的限制。我们开发了图像识别算法，可以完全自动化地操纵动物，包括在显微镜视野内定向和定位感兴趣的区域。我们还确定了对斑马鱼幼虫进行高分辨率、无失真、低背景成像的最佳毛细管材料。
The zebrafish larva is an optically-transparent vertebrate model with complex organs that is widely used to study genetics, developmental biology, and to model various human diseases. In this article, we present a set of novel technologies that significantly increase the throughput and capabilities of previously described vertebrate automated screening technology (VAST). We developed a robust multi-thread system that can simultaneously process multiple animals. System throughput is limited only by the image acquisition speed rather than by the fluidic or mechanical processes. We developed image recognition algorithms that fully automate manipulation of animals, including orienting and positioning regions of interest within the microscope’s field of view. We also identified the optimal capillary materials for high-resolution, distortion-free, low-background imaging of zebrafish larvae.
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影响因子：
48
作者：
Pardo-Martin, Carlos;Chang, Tsung-Yao;Koo, Bryan Kyo;Gilleland, Cody L.;Wasserman, Steven C.;Yanik, Mehmet Fatih
通讯作者：
Yanik, Mehmet Fatih
影响因子：
11.2
作者：
Tran, T. Cameron;Sneed, Blossom;Sandberg, Eric M.
通讯作者：
Sandberg, Eric M.
影响因子：
3.7
作者：
Carvalho, Ralph;de Sonneville, Jan;Spaink, Herman P.
通讯作者：
Spaink, Herman P.
影响因子：
14.8
作者：
Kokel, David;Bryan, Jennifer;Laggner, Christian;White, Rick;Cheung, Chung Yan J.;Mateus, Rita;Healey, David;Kim, Sonia;Werdich, Andreas A.;Haggarty, Stephen J.;MacRae, Calum A.;Shoichet, Brian;Peterson, Randall T.
通讯作者：
Peterson, Randall T.
DOI：
10.1126/science.1183090
发表时间：
2010-01-15
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Rihel J;Prober DA;Arvanites A;Lam K;Zimmerman S;Jang S;Haggarty SJ;Kokel D;Rubin LL;Peterson RT;Schier AF
通讯作者：
Schier AF