致病性大肠杆菌非编码小RNA(sRNAs)的研究进展

致病性大肠杆菌非编码小RNA(sRNAs)的研究进展
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DOI:
10.3969/j.issn.1008-0589.202106014
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发表时间:
2022
期刊:
中国预防兽医学报
影响因子:
--
通讯作者:
江丰伟
江丰伟
中科院分区:
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文献类型:
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作者:
杨延;毛曌;李干武;江丰伟

文献摘要

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细菌非编码小RNA(Small non-coding RNAs,sRNAs)是一类长度介于40 nt~500 nt不编码蛋白质的RNA分子,其半衰期短,常作为基因表达的调节物。sRNAs多由一段多变的靶标结合序列、保守序列和不依赖于Rho因子的转录终止序列等3部分组成,其形成的二级结构多存在茎环结构,该结构显著提高了sRNAs的稳定性。sRNAs与靶基因的配对方式多样,根据配对方式的不同,可以将细菌sRNAs分为顺式编码的sRNAs(Cis-encoded sRNAs)和反式编码的sRNAs(Trans-encoded sRNAs)。顺式编码的sRNAs存在于质粒、染色体、转座子等多种位置,由调控靶基因的反义链编码而来,能与靶基因的mRNA完全互补配对。反式编码的sRNAs是由与编码靶标mRNA的基因完全不同的基因组位置转录而来,这些sRNAs与靶标mRNAs的互补性较小且多依赖Hfq、ProQ、CsrA等RNA伴侣蛋白来维持其结构稳定性和功能的发挥。作为细菌众多调控网络中的重要分支,sRNAs通过直接或间接的作用方式在转录后水平调控靶基因的表达,进而对外界环境刺激做出迅速的反应。由于sRNAs在调控基因表达方面存在耗能低、反应快等优势,因此针对sRNAs及其生物学功能的研究一直是近年来的研究重点。