Folding of RNA tertiary structure: Linkages between backbone phosphates, ions, and water.
Folding of RNA tertiary structure: Linkages between backbone phosphates, ions, and water.
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DOI：
10.1002/bip.22249
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发表时间：
2013-12
期刊：
影响因子：
2.9
通讯作者：
Draper, David E.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Draper, David E.
许多RNA的功能形式具有紧凑的结构。磷酸盐在这种结构中的位置不仅受到磷酸盐之间强静电排斥的影响，而且还受到磷酸盐、水和移动的离子之间相互作用网络的影响。这篇评论首先探讨了什么已经学会了这些安排的基本热力学约束的水合作用和离子在简单的DNA分子的研究，然后给出了一个概述什么是已知的离子和水与RNA结构的相互作用。RNA晶体结构的简要调查确定了几个有趣的架构，其中紧密间隔的磷酸盐共享水化壳或磷酸盐被埋在提供分子内氢键或位点结合阳离子的环境中。这些结构的形成必须需要离子的吸收和水的释放之间的强耦合。
The functional forms of many RNAs have compact architectures. The placement of phosphates within such structures must be influenced not only by the strong electrostatic repulsion between phosphates, but also by networks of interactions between phosphates, water, and mobile ions. This review first explores what has been learned of the basic thermodynamic constraints on these arrangements from studies of hydration and ions in simple DNA molecules, and then gives an overview of what is known about ion and water interactions with RNA structures. A brief survey of RNA crystal structures identifies several interesting architectures in which closely spaced phosphates share hydration shells or phosphates are buried in environments that provide intramolecular hydrogen bonds or site-bound cations. Formation of these structures must require strong coupling between the uptake of ions and release of water.
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DOI：
10.1073/pnas.47.7.1005
发表时间：
1961-01-01
影响因子：
11.1
作者：
HEARST, JE;VINOGRAD, J
通讯作者：
VINOGRAD, J
影响因子：
2.9
作者：
Hong, J;Capp, MW;Record, MT
通讯作者：
Record, MT
影响因子：
5.6
作者：
Lambert D;Leipply D;Draper DE
通讯作者：
Draper DE
影响因子：
5.6
作者：
Conn, GL;Gittis, AG;Draper, DE
通讯作者：
Draper, DE
影响因子：
4.4
作者：
HILL, TL
通讯作者：
HILL, TL