基于分子生物信息学分析小麦球蛋白的理化 特性与结构预测

基于分子生物信息学分析小麦球蛋白的理化 特性与结构预测
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DOI:
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发表时间:
2019
期刊:
河南工业大学学报(自然科学版)
影响因子:
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通讯作者:
王金水
王金水
中科院分区:
其他
文献类型:
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作者:
贾峰;耿瑞谍;刘中文;陈雨;刘笑谦;王金水

文献摘要

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为探讨小麦球蛋白在理化特性及分子结构方面的共性与特性,基于 NCBI 蛋白质数据库,.利用 Protparam、Clustalw、MEME program3、PSIPRED 3.3 等软件对 8 条小麦球蛋白的理化性质、多.序列比对、系统进化树、保守基序、蛋白质二级结构、域结构、折叠域识别等进行预测分析。结果.表明:小麦球蛋白的氨基酸残基数为 225~637,分子质量为 24.55~72.25 kDa,理论等电点为.5.22~8.72,总平均亲水性为-1.074~0.045,不稳定系数为 36.02~77.64,脂肪系数为 57.05~96.09。.在多序列比对方面,小麦球蛋白存在较多保守区域;在基序分析方面,小麦球蛋白中有 6 个保守.的基序;在结构预测方面,小麦球蛋白的域结构和折叠域差异较小;在蛋白质二级结构方面,氨.基酸残基在 225~241 之间的小麦球蛋白由 α-螺旋和无规则卷曲等结构元件组成,基本上不存在.延伸链;氨基酸残基在 504~637 之间的小麦球蛋白则由 α-螺旋、延伸链和无规则卷曲等结构元.件组成,且三者的比例约为无规则卷曲∶延伸链∶α-螺旋=3∶1∶1。这些结果可为小麦球蛋白的分离.纯化及其利用提供生物学数据参考。