SCoPE-MS: mass spectrometry of single mammalian cells quantifies proteome heterogeneity during cell differentiation.
SCoPE-MS: mass spectrometry of single mammalian cells quantifies proteome heterogeneity during cell differentiation.
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DOI：
10.1186/s13059-018-1547-5
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发表时间：
2018-10-22
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Slavov N
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Budnik B;Levy E;Harmange G;Slavov N
一些令人兴奋的生物学问题需要量化单个细胞中的数千种蛋白质。为了实现这一目标，我们开发了单细胞质谱蛋白质组学（SCoPE-MS），并验证了其基于蛋白质组识别不同人类癌细胞类型的能力。我们使用SCoPE-MS来量化分化小鼠胚胎干细胞中的一千多种蛋白质。单细胞蛋白质组使我们能够解构细胞群体并推断蛋白质丰度关系。单细胞蛋白质组和转录组之间的比较表明协调的mRNA和蛋白质的共变，但许多基因表现出功能协调和不同的监管模式在mRNA和蛋白质水平。本文的在线版本（10.1186/s13059-018-1547-5）包含补充材料，可供授权用户使用。
Some exciting biological questions require quantifying thousands of proteins in single cells. To achieve this goal, we develop Single Cell ProtEomics by Mass Spectrometry (SCoPE-MS) and validate its ability to identify distinct human cancer cell types based on their proteomes. We use SCoPE-MS to quantify over a thousand proteins in differentiating mouse embryonic stem cells. The single-cell proteomes enable us to deconstruct cell populations and infer protein abundance relationships. Comparison between single-cell proteomes and transcriptomes indicates coordinated mRNA and protein covariation, yet many genes exhibit functionally concerted and distinct regulatory patterns at the mRNA and the protein level. The online version of this article (10.1186/s13059-018-1547-5) contains supplementary material, which is available to authorized users.
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DOI：
10.1074/mcp.m111.011015
发表时间：
2011-09
期刊：
Molecular & cellular proteomics : MCP
影响因子：
--
作者：
Michalski A;Damoc E;Hauschild JP;Lange O;Wieghaus A;Makarov A;Nagaraj N;Cox J;Mann M;Horning S
通讯作者：
Horning S
DOI：
10.1126/science.1198704
发表时间：
2011-05-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Bendall SC;Simonds EF;Qiu P;Amir el-AD;Krutzik PO;Finck R;Bruggner RV;Melamed R;Trejo A;Ornatsky OI;Balderas RS;Plevritis SK;Sachs K;Pe'er D;Tanner SD;Nolan GP
通讯作者：
Nolan GP
影响因子：
4.4
作者：
Cox, Juergen;Neuhauser, Nadin;Mann, Matthias
通讯作者：
Mann, Matthias
影响因子：
7
作者：
Li, Siyang;Plouffe, Brian D.;Ivanov, Alexander R.
通讯作者：
Ivanov, Alexander R.
影响因子：
8.8
作者：
Darmanis S;Gallant CJ;Marinescu VD;Niklasson M;Segerman A;Flamourakis G;Fredriksson S;Assarsson E;Lundberg M;Nelander S;Westermark B;Landegren U
通讯作者：
Landegren U