Protocol to assess receptor-ligand binding in C. elegans using adapted thermal shift assays.
Protocol to assess receptor-ligand binding in C. elegans using adapted thermal shift assays.
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DOI：
10.1016/j.xpro.2023.102477
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发表时间：
2023-09-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Pukkila-Worley, Read
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Tse, Samantha Y.;Pukkila-Worley, Read
秀丽隐杆线虫基因组编码数量大大增加的核激素受体，其中许多仍然是孤儿。在这里，我们提出了一个协议，使用适应的细胞热位移测定和等温剂量反应来评估线虫中的配体-受体结合。我们描述了培养线虫以及制备裂解物和化合物的步骤。我们还详细介绍了如何执行和量化这些测定。该方案可用于研究任何可溶性受体。有关该协议的使用和执行的完整详细信息，请参阅 Peterson 等人。 （2023）。使用热位移测定评估秀丽隐杆线虫配体-受体结合的方案 可用于去除孤儿核激素受体的方案 适用于秀丽隐杆线虫中的任何可溶性受体 出版商说明：进行任何实验方案都需要遵守当地实验室安全和道德机构指南。秀丽隐杆线虫基因组编码数量大大增加的核激素受体，其中许多仍然是孤儿。在这里，我们提出了一个协议，使用适应的细胞热位移测定和等温剂量反应来评估线虫中的配体-受体结合。我们描述了培养线虫以及制备裂解物和化合物的步骤。我们还详细介绍了如何执行和量化这些测定。该方案可用于研究任何可溶性受体。
The Caenorhabditis elegans genome encodes a greatly expanded number of nuclear hormone receptors, many of which remain orphaned. Here, we present a protocol to assess ligand-receptor binding in C. elegans using an adapted cellular thermal shift assay and isothermal dose response. We describe steps for growing C. elegans and preparing lysates and compounds. We also detail how to perform and quantify these assays. This protocol can be used to study any soluble receptor. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Peterson et al. (2023). Protocol to assess C. elegans ligand-receptor binding using thermal shift assays Accessible protocol to de-orphan nuclear hormone receptors Adaptable to any soluble receptor in C. elegans Publisher’s note: Undertaking any experimental protocol requires adherence to local institutional guidelines for laboratory safety and ethics. The Caenorhabditis elegans genome encodes a greatly expanded number of nuclear hormone receptors, many of which remain orphaned. Here, we present a protocol to assess ligand-receptor binding in C. elegans using an adapted cellular thermal shift assay and isothermal dose response. We describe steps for growing C. elegans and preparing lysates and compounds. We also detail how to perform and quantify these assays. This protocol can be used to study any soluble receptor.
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影响因子：
--
作者：
Ghanta KS;Ishidate T;Mello CC
通讯作者：
Mello CC
影响因子：
32.4
作者：
Peterson，Nicholas D.;Tse，Samantha Y.;Pukkila-Worley，Read
通讯作者：
Pukkila-Worley，Read
影响因子：
3.3
作者：
Dokshin GA;Ghanta KS;Piscopo KM;Mello CC
通讯作者：
Mello CC
影响因子：
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作者：
Velazquez-Campoy, Adrian;Freire, Ernesto
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Freire, Ernesto
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4.6
作者：
Tillman, Matthew C.;Khadka, Manoj;Ortlund, Eric A.
通讯作者：
Ortlund, Eric A.