Locus-specific ribosomal RNA gene silencing in nucleolar dominance.
Locus-specific ribosomal RNA gene silencing in nucleolar dominance.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0000815
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发表时间：
2007-08-29
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Pikaard CS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lewis MS;Pikaard DJ;Nasrallah M;Doelling JH;Pikaard CS
在遗传杂种中，一组亲本rRNA基因的沉默是一种称为核仁显性的表观遗传现象。我们先前表明，沉默仅限于核仁组织者区（NOR），rRNA基因串联排列的位点，并且不会扩散到邻近的蛋白质编码基因或从邻近的蛋白质编码基因扩散。一种假说认为，核仁优势是一次作用于一个rRNA基因的数百个沉默事件的最终结果。这一假说的一个预测是，rRNA基因沉默应该发生独立的染色体位置。另一种假设是，核仁优势的调节单位是NOR，而不是每个单独的rRNA基因，在这种情况下，NOR定位可能是rRNA基因沉默所必需的。为了检验这些替代假设，我们研究了rRNA转基因整合在异位位置的命运。转基因准确地转录在所有独立的转基因拟南芥线测试，表明NOR定位是不需要的rRNA基因表达。转基因A. thaliana株系为胚珠亲本，A.将A. lyrata的内源rRNA基因定位于A. thaliana的NORs沉默。然而，rRNA转基因逃脱沉默在多个独立的杂交。总的来说，我们的数据表明，rRNA基因的激活可以发生在一个基因自主的方式，独立的染色体位置，而rRNA基因沉默的核仁优势基因座依赖。
The silencing of one parental set of rRNA genes in a genetic hybrid is an epigenetic phenomenon known as nucleolar dominance. We showed previously that silencing is restricted to the nucleolus organizer regions (NORs), the loci where rRNA genes are tandemly arrayed, and does not spread to or from neighboring protein-coding genes. One hypothesis is that nucleolar dominance is the net result of hundreds of silencing events acting one rRNA gene at a time. A prediction of this hypothesis is that rRNA gene silencing should occur independent of chromosomal location. An alternative hypothesis is that the regulatory unit in nucleolar dominance is the NOR, rather than each individual rRNA gene, in which case NOR localization may be essential for rRNA gene silencing. To test these alternative hypotheses, we examined the fates of rRNA transgenes integrated at ectopic locations. The transgenes were accurately transcribed in all independent transgenic Arabidopsis thaliana lines tested, indicating that NOR localization is not required for rRNA gene expression. Upon crossing the transgenic A. thaliana lines as ovule parents with A. lyrata to form F1 hybrids, a new system for the study of nucleolar dominance, the endogenous rRNA genes located within the A. thaliana NORs are silenced. However, rRNA transgenes escaped silencing in multiple independent hybrids. Collectively, our data suggest that rRNA gene activation can occur in a gene-autonomous fashion, independent of chromosomal location, whereas rRNA gene silencing in nucleolar dominance is locus-dependent.
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DOI：
10.1002/9780470988626.ch7
发表时间：
2005-01-01
期刊：
PLANT EPIGENETICS
影响因子：
--
作者：
Neves, Nuno;Viegas, Wanda;Pikaard, Craig S.
通讯作者：
Pikaard, Craig S.
影响因子：
7.2
作者：
Kononov, ME;Bassuner, B;Gelvin, SB
通讯作者：
Gelvin, SB
影响因子：
16
作者：
Lawrence, RJ;Earley, K;Pikaard, CS
通讯作者：
Pikaard, CS
DOI：
10.1073/pnas.251424098
发表时间：
2001-12-04
影响因子：
11.1
作者：
Lewis, MS;Pikaard, CS
通讯作者：
Pikaard, CS
影响因子：
7.2
作者：
Copenhaver, GP;Pikaard, CS
通讯作者：
Pikaard, CS