Super-STORM: Molecular Modeling to Achieve Single-molecule Localization with STORM Microscopy.
Super-STORM: Molecular Modeling to Achieve Single-molecule Localization with STORM Microscopy.
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DOI：
10.1016/j.xpro.2019.100012
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发表时间：
2020-06-19
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ley K
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fan Z;Mikulski Z;McArdle S;Sundd P;Ley K
该协议介绍了SuperSTORM技术，结合随机光学重建显微镜（STORM）和分子建模。SuperSTORM针对中性粒细胞整联蛋白的STORM图像采集和处理进行了优化，但也可用于任何具有已知结构和抗体结合位点的细胞表面分子。SuperSTORM识别用于消除STORM成像的多次闪烁的分子截止值，确定共定位，识别簇，并揭示分子取向和分布。该协议将STORM成像扩展到微流体系统中的细胞。通过使用生物分子固有参数来实现改进的分辨率。有关本协议生成和使用的完整信息，请参阅的论文。SuperSTORM将STORM和分子建模相结合，以提高分辨率SuperSTORM识别分子截止点，以找到单个蛋白质分子SuperSTORM揭示簇、分子取向和分布SuperSTORM可与任何STORM显微镜配合使用该协议引入了SuperSTORM技术，将随机光学重建显微镜（STORM）和分子建模相结合。SuperSTORM针对中性粒细胞整联蛋白的STORM图像采集和处理进行了优化，但也可用于任何具有已知结构和抗体结合位点的细胞表面分子。SuperSTORM识别用于消除STORM成像的多次闪烁的分子截止值，确定共定位，识别簇，并揭示分子取向或分布。该协议将STORM成像扩展到微流体系统中的细胞。通过使用生物分子固有参数来实现改进的分辨率。
This protocol introduces the SuperSTORM technique, combining stochastic optical reconstruction microscopy (STORM) and molecular modeling. SuperSTORM is optimized for acquiring and processing STORM images of neutrophil integrins but can be used for any cell-surface molecule with known structure and antibody-binding site(s). SuperSTORM identifies molecular cut-offs for eliminating multiple blinks of STORM imaging, determines colocalization, identifies clusters, and reveals molecular orientations and distributions. This protocol extends STORM imaging to cells in microfluidic systems. Improved resolution is achieved by using biomolecule-inherent parameters. For complete information on the generation and use of this protocol, please refer to the paper by. SuperSTORM combines STORM and molecular modeling to improve resolution SuperSTORM identifies molecular cut-offs to find individual protein molecules SuperSTORM reveals clusters, molecular orientations and distributions SuperSTORM works with any STORM microscope This protocol introduces the SuperSTORM technique, combining stochastic optical reconstruction microscopy (STORM) and molecular modeling. SuperSTORM is optimized for acquiring and processing STORM images of neutrophil integrins but can be used for any cell-surface molecule with known structure and antibody-binding site(s). SuperSTORM identifies molecular cut-offs for eliminating multiple blinks of STORM imaging, determines colocalization, identifies clusters, and reveals molecular orientations or distributions. This protocol extends STORM imaging to cells in microfluidic systems. Improved resolution is achieved by using biomolecule-inherent parameters.
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影响因子：
5.5
作者：
Sun, Hao;Fan, Zhichao;Ley, Klaus
通讯作者：
Ley, Klaus
呈现您的结构：CCP4MG分子图形软件。
DOI：
10.1107/s0907444911007281
发表时间：
2011-04
期刊：
Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography
影响因子：
--
作者：
McNicholas S;Potterton E;Wilson KS;Noble ME
通讯作者：
Noble ME
影响因子：
64.8
作者：
Sundd, Prithu;Gutierrez, Edgar;Koltsova, Ekaterina K.;Kuwano, Yoshihiro;Fukuda, Satoru;Pospieszalska, Maria K.;Groisman, Alex;Ley, Klaus
通讯作者：
Ley, Klaus
影响因子：
3
作者：
Rueden CT;Schindelin J;Hiner MC;DeZonia BE;Walter AE;Arena ET;Eliceiri KW
通讯作者：
Eliceiri KW
影响因子：
48
作者：
Huang, Bo;Jones, Sara A.;Brandenburg, Boerries;Zhuang, Xiaowei
通讯作者：
Zhuang, Xiaowei