Algebraic Systems for DNA Origami Motivated from Temperley-Lieb Algebras
Algebraic Systems for DNA Origami Motivated from Temperley-Lieb Algebras
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源自 Temperley-Lieb 代数的 DNA 折纸代数系统
DOI：
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发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
M. Saito
中科院分区：
文献类型：
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作者：
James Garrett;Natavsa Jonoska;Hwee Kim;M. Saito
我们启动了一种代数方法来研究DNA折纸结构，方法是将么半群中的一个元素与每个结构相关联。我们识别了两种类型的基本构建块，并描述了DNA折纸结构及其组成。这些构造块被视为一个么半群的生成元，被称为折纸么半群，并且，在研究得很好的Temperley-Lieb代数的激励下，我们确定了一组表征折纸么半群的关系。我们还给出了关于折纸么半群的格林关系的几个结果，并研究了它与Jones么半群的叉积的关系，该叉积是折纸么半群的态象。
We initiate an algebraic approach to study DNA origami structures by associating an element from a monoid to each structure. We identify two types of basic building blocks and describe an DNA origami structure with their composition. These building blocks are taken as generators of a monoid, called origami monoid, and, motivated by the well studied Temperley-Lieb algebras, we identify a set of relations that characterize the origami monoid. We also present several observations about the Green's relations for the origami monoid and study the relations to a cross product of Jones monoids that is a morphic image of an origami monoid.