Genome-wide analysis of a G-quadruplex-specific single-chain antibody that regulates gene expression.
Genome-wide analysis of a G-quadruplex-specific single-chain antibody that regulates gene expression.
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DOI：
10.1093/nar/gkp740
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发表时间：
2009-11
影响因子：
14.9
通讯作者：
Balasubramanian S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Fernando H;Sewitz S;Darot J;Tavaré S;Huppert JL;Balasubramanian S
g -四重体核酸被认为在包括转录和翻译在内的许多基本生物学过程中发挥作用。我们已经开发了一种单链抗体，它对g -四重体DNA比双链DNA有选择性，并在这里表明，当它在人类细胞中表达时，它会显著影响多种基因的表达，以一种与预测的g -四重体存在相关的方式。我们观察到基因表达增加或减少的情况，并且在基因的开始和结束以及在任何一条链上都有与g -四重基序的明显相互作用。这项全基因组研究的结果表明，抗体识别g -四重体具有生理后果，并提供了一些与g -四重体调控相关的复杂性的见解。
G-quadruplex nucleic acids have been proposed to play a role in a number of fundamental biological processes that include transcription and translation. We have developed a single-chain antibody that is selective for G-quadruplex DNA over double-stranded DNA, and here show that when it is expressed in human cells, it significantly affects the expression of a wide variety of genes, in a manner that correlates with the presence of predicted G-quadruplexes. We observe cases where gene expression is increased or decreased, and that there are apparent interactions with G-quadruplex motifs at the beginning and end of the genes, and on either strand. The outcomes of this genome-wide study demonstrate that G-quadruplex recognition by the antibody has physiological consequences, and provides insights into some of the complexity associated with G-quadruplex-based regulation.
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