High-sensitivity TFA-free LC-MS for profiling histones.
High-sensitivity TFA-free LC-MS for profiling histones.
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DOI：
10.1002/pmic.201000445
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发表时间：
2011-08
期刊：
影响因子：
3.4
通讯作者：
Freitas, Michael A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
You, Jia;Wang, Liwen;Saji, Motoyasu;Olesik, Susan V.;Ringel, Matthew D.;Lucas, David M.;Byrd, John C.;Freitas, Michael A.
通过反相液相色谱（RPLC）分析蛋白质通常涉及使用TFA作为离子配对剂，即使它形成加合物并抑制敏感性。加合物的存在会使蛋白质分子量分配复杂化，特别是当蛋白质同工异构体形成时，如组蛋白。为了减轻TFA加合物在蛋白质LC-MS中的复杂作用，我们优化了不含TFA的蛋白质分离方法。使用毛细管（0.3 mm id）和纳米级（0.1 mm id） C8柱与离子配对剂甲酸或乙酸，用蛋白标准和组蛋白评价无tfa分离。然后将优化后的方法应用于人类癌细胞系和慢性淋巴细胞白血病原代肿瘤细胞的组蛋白鉴定。
The analysis of proteins by reversed-phase liquid chromatography (RPLC) commonly involves the use of TFA as an ion-pairing agent, even though it forms adducts and suppresses sensitivity. The presence of adducts can complicate protein molecular weight assignment especially when protein isoforms coelute as in the case of histones. To mitigate the complicating effects of TFA adducts in protein LC-MS, we have optimized TFA-free methods for protein separation. Protein standards and histones were used to evaluate TFA-free separations using capillary (0.3 mm id) and nanoscale (0.1 mm id) C8 columns with the ion-pairing agents, formic acid or acetic acid. The optimized method was then used to examine the applicability of the approach for histone characterization in human cancer cell lines and primary tumor cells from chronic lymphocytic leukemia patients.
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影响因子：
16
作者：
Lo, WS;Trievel, RC;Berger, SL
通讯作者：
Berger, SL
影响因子：
4.8
作者：
Debnath, J;Muthuswamy, SK;Brugge, JS
通讯作者：
Brugge, JS
DOI：
10.1073/pnas.0710515105
发表时间：
2008-03-18
影响因子：
11.1
作者：
Phanstiel, Doug;Brumbaugh, Justin;Coon, Joshua J.
通讯作者：
Coon, Joshua J.
影响因子：
4.8
作者：
Nicklay, Joshua J.;Shechter, David;Hunt, Donald F.
通讯作者：
Hunt, Donald F.
影响因子：
2
作者：
Chong, BE;Yan, F;Miller, FR
通讯作者：
Miller, FR