Mapping mammalian replication domains using the ion torrent semiconductor sequencing platform

Mapping mammalian replication domains using the ion torrent semiconductor sequencing platform
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使用 ion torrent 半导体测序平台绘制哺乳动物复制域图

DOI：
10.1080/09168451.2018.1515617
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发表时间：
2018
期刊：
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
影响因子：
--
通讯作者：
Okumura Katsuzumi
Okumura Katsuzumi
中科院分区：
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文献类型：
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作者：
Takebayashi Shin-ichiro;Ogata Shin;Ogata Masato;Okumura Katsuzumi

文献摘要

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在这里，我们表明，基于半导体的测序技术可以用于绘制哺乳动物复制结构域，即具有相似DNA复制时间的染色体单位。用Ion Torrent平台对从哺乳动物细胞中纯化的复制DNA进行了成功测序。由此得到的小鼠胚胎干细胞复制结构域图与传统的基于微阵列的方法获得的复制结构域图相当。
Here, we show that semiconductor-based sequencing technology can be used to map mammalian replication domains, chromosomal units with similar DNA replication timing. Replicating DNA purified from mammalian cells was successfully sequenced by the Ion Torrent platform. The resultant replication domain map of mouse embryonic stem cells is comparable to those obtained by the conventional microarray-based method.